More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0499 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0499  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156783  hitchhiker  0.0000260777 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1086  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  56.18 
 
 		 286 aa  321  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0696553 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  55.51 
 
 		 331 aa  270  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0084  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  49.62 
 
 		 271 aa  258  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0376016  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1379  ferredoxin  49.61 
 
 		 265 aa  251  6e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000430002  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0533  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  48.65 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0347  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  51.26 
 
 		 269 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  46.85 
 
 		 266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1321  ferredoxin  45.21 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1322  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.06 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122015  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0216  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  46.86 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00676353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1528  ferredoxin  44.44 
 
 		 279 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0694  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.64 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0264  ferredoxin  42.37 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1309  ferredoxin  41.73 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.510214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2435  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.77 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0517  ferredoxin  42.47 
 
 		 295 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1955  ferredoxin  40.53 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.356544  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0067  Fe-S cluster domain-containing protein  41.9 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.730786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2474  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.25 
 
 		 269 aa  191  8e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275418 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0989  ferredoxin  39.1 
 
 		 279 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1154  ferredoxin  41.27 
 
 		 277 aa  185  6e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.445743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0586  ferredoxin  40.15 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1894  ferredoxin  43.22 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000460706  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0303  ferredoxin  38.46 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.606306 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1243  ferredoxin  36.7 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0546  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  37.79 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.54841e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2694  ferredoxin  39.85 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378888 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2511  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  46.77 
 
 		 672 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0311  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  39.62 
 
 		 303 aa  148  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.287038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.94 
 
 		 699 aa  136  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  36.6 
 
 		 194 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1791  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.3 
 
 		 194 aa  118  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445554  hitchhiker  0.00820964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  36.55 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02730  electron transport complex protein RnfB  38.04 
 
 		 193 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000653403  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2966  electron transport complex protein RnfB  35.6 
 
 		 188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2198  electron transport complex protein RnfB  35.48 
 
 		 189 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.401389  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1820  electron transport complex protein RnfB  37.57 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0689  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.1 
 
 		 181 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0763573  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1568  electron transport complex protein RnfB  35.94 
 
 		 192 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0321479 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01598  electron transport complex protein RnfB  38.3 
 
 		 192 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000941545  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2013  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.3 
 
 		 192 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1704  electron transport complex protein RnfB  38.3 
 
 		 192 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2340  electron transport complex protein RnfB  38.3 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.297329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  35.96 
 
 		 197 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1628  electron transport complex protein RnfB  35.94 
 
 		 192 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0262939  normal  0.320495 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1571  electron transport complex protein RnfB  38.3 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01588  hypothetical protein  38.3 
 
 		 192 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1836  electron transport complex protein RnfB  38.3 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.912519  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1884  electron transport complex protein RnfB  35.94 
 
 		 192 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2001  electron transport complex protein RnfB  38.3 
 
 		 192 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000498524  normal  0.338717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1716  electron transport complex protein RnfB  35.42 
 
 		 192 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.270473  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  33.69 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1556  electron transport complex protein RnfB  35.42 
 
 		 192 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0733084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1544  electron transport complex protein RnfB  34.45 
 
 		 198 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831464 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  35.59 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2173  electron transport complex protein RnfB  34.54 
 
 		 193 aa  105  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0287954  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2557  electron transport complex protein RnfB  35.26 
 
 		 189 aa  105  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  36.07 
 
 		 178 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  35.59 
 
 		 198 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1817  electron transport complex protein RnfB  37.23 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0338518  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1786  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.94 
 
 		 192 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2007  electron transport complex protein RnfB  32.98 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1895  electron transport complex protein RnfB  32.98 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2253  electron transport complex protein RnfB  34.55 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2627  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.64 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1035  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.29 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2354  electron transport complex protein RnfB  33.16 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.720002  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  34.21 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  33.68 
 
 		 193 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  34.21 
 
 		 193 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2823  electron transport complex, B subunit  31.5 
 
 		 182 aa  99.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0937  electron transport complex protein RnfB  36.21 
 
 		 192 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.556541  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  33.68 
 
 		 193 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2240  electron transport complex protein RnfB  36.32 
 
 		 190 aa  99  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000443884 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.33 
 
 		 184 aa  99  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2400  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB  36.31 
 
 		 206 aa  98.2  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.942423 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1060  electron transport complex protein RnfB  35.91 
 
 		 196 aa  97.4  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2324  electron transport complex protein RnfB  36.42 
 
 		 192 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  33.16 
 
 		 204 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  32.63 
 
 		 199 aa  96.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  33.16 
 
 		 204 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  33.16 
 
 		 204 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1162  electron transport complex protein RnfB  34.97 
 
 		 180 aa  95.9  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  39.13 
 
 		 188 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0473015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  32.63 
 
 		 199 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0284  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.51 
 
 		 181 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.419432  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  32.63 
 
 		 199 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2024  electron transport complex protein RnfB  36.42 
 
 		 192 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  32.96 
 
 		 189 aa  93.6  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2043  electron transport complex protein RnfB  34.86 
 
 		 189 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0243874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1403  electron transport complex protein RnfB  36.31 
 
 		 191 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2155  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.72 
 
 		 196 aa  92.4  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1573  Fe-S cluster domain-containing protein  55.17 
 
 		 92 aa  92.4  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2067  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.71 
 
 		 189 aa  90.1  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0305749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1639  electron transport complex protein RnfB  31.66 
 
 		 188 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18930  electron transport complex protein RnfB  31.12 
 
 		 188 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000143693  normal  0.123767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1493  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.16 
 
 		 177 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1608  Fe-S cluster domain-containing protein  50.57 
 
 		 92 aa  88.6  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.785363  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1174  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.13 
 
 		 209 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>