More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1035 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1035  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  100 
 
 		 190 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2627  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  55.61 
 
 		 186 aa  214  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  57.39 
 
 		 183 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1791  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  55.98 
 
 		 194 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445554  hitchhiker  0.00820964 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1786  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  57.87 
 
 		 192 aa  210  9e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02730  electron transport complex protein RnfB  59.3 
 
 		 193 aa  209  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000653403  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  59.76 
 
 		 184 aa  208  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2173  electron transport complex protein RnfB  57.95 
 
 		 193 aa  206  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0287954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  56 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  58.05 
 
 		 178 aa  204  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2966  electron transport complex protein RnfB  56.32 
 
 		 188 aa  203  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0937  electron transport complex protein RnfB  60.37 
 
 		 192 aa  200  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.556541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2354  electron transport complex protein RnfB  55.23 
 
 		 189 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.720002  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  52.33 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  52.91 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  52.91 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1544  electron transport complex protein RnfB  54.86 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  52.33 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  52.33 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  52.33 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  52.33 
 
 		 199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  52.33 
 
 		 193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  52.33 
 
 		 199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1162  electron transport complex protein RnfB  54.49 
 
 		 180 aa  197  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  51.74 
 
 		 199 aa  197  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  52.33 
 
 		 194 aa  197  7.999999999999999e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19260  electron transport complex protein RnfB  55.11 
 
 		 187 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1174  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  55.83 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  55.35 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1864  electron transport complex protein RnfB  56.96 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.164914  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1895  electron transport complex protein RnfB  51.18 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2007  electron transport complex protein RnfB  51.18 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2253  electron transport complex protein RnfB  51.18 
 
 		 188 aa  191  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2557  electron transport complex protein RnfB  53.49 
 
 		 189 aa  190  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  0.143119 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01598  electron transport complex protein RnfB  51.14 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000941545  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2013  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  51.14 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01588  hypothetical protein  51.14 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2001  electron transport complex protein RnfB  51.14 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000498524  normal  0.338717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1704  electron transport complex protein RnfB  51.14 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1836  electron transport complex protein RnfB  50.57 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.912519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1571  electron transport complex protein RnfB  50.57 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2340  electron transport complex protein RnfB  50.57 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.297329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  54.43 
 
 		 195 aa  188  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1820  electron transport complex protein RnfB  52.76 
 
 		 192 aa  188  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173992 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1817  electron transport complex protein RnfB  50 
 
 		 192 aa  187  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0338518  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2043  electron transport complex protein RnfB  57.32 
 
 		 189 aa  187  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0243874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  55.7 
 
 		 189 aa  187  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  55 
 
 		 198 aa  187  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1884  electron transport complex protein RnfB  50.59 
 
 		 192 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1628  electron transport complex protein RnfB  50.59 
 
 		 192 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0262939  normal  0.320495 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1568  electron transport complex protein RnfB  50.59 
 
 		 192 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0321479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18930  electron transport complex protein RnfB  52 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000143693  normal  0.123767 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1556  electron transport complex protein RnfB  50 
 
 		 192 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0733084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1716  electron transport complex protein RnfB  50 
 
 		 192 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.270473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1403  electron transport complex protein RnfB  56.44 
 
 		 191 aa  184  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1639  electron transport complex protein RnfB  50.56 
 
 		 188 aa  184  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2240  electron transport complex protein RnfB  55.26 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000443884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2155  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50.94 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2198  electron transport complex protein RnfB  49.44 
 
 		 189 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.401389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2400  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB  54.49 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.942423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2024  electron transport complex protein RnfB  50.31 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2324  electron transport complex protein RnfB  50.31 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1917  electron transport complex protein RnfB  50.32 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1060  electron transport complex protein RnfB  49.71 
 
 		 196 aa  174  5e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2067  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  55.92 
 
 		 189 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0305749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0815  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  54.04 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0689  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  46.86 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0763573  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2823  electron transport complex, B subunit  42.86 
 
 		 182 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0720  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  48.04 
 
 		 681 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340491  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0937  ferredoxin  50.32 
 
 		 276 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3619  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  51.35 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111565  normal  0.0672308 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0284  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.05 
 
 		 181 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.419432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1047  ferredoxin  50 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1015  ferredoxin  50.71 
 
 		 279 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0219422  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2487  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  52.14 
 
 		 243 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2121  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  56.59 
 
 		 335 aa  148  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412453  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2705  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  49.02 
 
 		 259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  51.45 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5668  ferredoxin  49.66 
 
 		 334 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0850  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50.35 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.223684  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0994  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50.35 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0262542  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2064  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  51.45 
 
 		 217 aa  144  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.295108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2137  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  54 
 
 		 291 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0872  ferredoxin  48.05 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2245  ferredoxin  46.41 
 
 		 341 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.666336 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2341  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  48.03 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0747882  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2365  ferredoxin  46.41 
 
 		 339 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2296  putative electron transport-related protein  51.8 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.364932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0951  ferredoxin  46.62 
 
 		 320 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1714  ferredoxin  48.28 
 
 		 342 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2326  ferredoxin  48.28 
 
 		 342 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2349  ferredoxin  48.28 
 
 		 306 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108055 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1006  ferredoxin  46.5 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.110987 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1754  ferredoxin  51.54 
 
 		 139 aa  138  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1680  ferredoxin  51.54 
 
 		 139 aa  138  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2975  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  47.92 
 
 		 224 aa  138  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2096  ferredoxin  47.62 
 
 		 291 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1493  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  39.25 
 
 		 177 aa  137  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2376  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  49.32 
 
 		 231 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.532877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>