More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2296 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2296  putative electron transport-related protein  100 
 
 
228 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.364932  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2975  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  58.9 
 
 
224 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2376  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  57.56 
 
 
231 aa  236  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.532877  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2170  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  61.76 
 
 
221 aa  234  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.211409 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  64.37 
 
 
212 aa  228  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2064  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  64.37 
 
 
217 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.295108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2137  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  59.11 
 
 
214 aa  224  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3619  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  70.13 
 
 
238 aa  223  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111565  normal  0.0672308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2487  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  70.3 
 
 
243 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1047  ferredoxin  58.41 
 
 
248 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3310  ferredoxin  69.93 
 
 
279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5668  ferredoxin  66.01 
 
 
334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2365  ferredoxin  66.01 
 
 
339 aa  214  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2245  ferredoxin  66.01 
 
 
341 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.666336 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2349  ferredoxin  67.32 
 
 
306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2341  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  56.84 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0747882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1714  ferredoxin  67.32 
 
 
342 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2326  ferredoxin  67.32 
 
 
342 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2096  ferredoxin  50 
 
 
291 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0951  ferredoxin  65.36 
 
 
320 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143394  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0937  ferredoxin  56.88 
 
 
276 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0464  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  56.7 
 
 
228 aa  204  8e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0463817  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1236  ferredoxin  69.01 
 
 
279 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0872  ferredoxin  55.96 
 
 
276 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1015  ferredoxin  58.8 
 
 
279 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0219422  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1006  ferredoxin  54.84 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.110987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0273  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  72.39 
 
 
220 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1498  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  52.68 
 
 
230 aa  194  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0971  ferredoxin  64.79 
 
 
282 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1930  ferredoxin  63.38 
 
 
316 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1337  ferredoxin  63.38 
 
 
316 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1023  ferredoxin  63.38 
 
 
290 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1184  ferredoxin  63.38 
 
 
290 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1176  ferredoxin  63.38 
 
 
290 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0842  ferredoxin  63.38 
 
 
290 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.736914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0306  ferredoxin  63.38 
 
 
290 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0850  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  49.54 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.223684  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0994  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  49.54 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0262542  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  64.29 
 
 
178 aa  181  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  62.41 
 
 
183 aa  181  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2705  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  43.51 
 
 
259 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  64.84 
 
 
188 aa  175  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2121  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  54.39 
 
 
335 aa  170  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1162  electron transport complex protein RnfB  52.83 
 
 
180 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2627  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  58.57 
 
 
186 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.3 
 
 
291 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1786  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  62.79 
 
 
192 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1544  electron transport complex protein RnfB  52.2 
 
 
198 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831464 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02730  electron transport complex protein RnfB  56.43 
 
 
193 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000653403  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1791  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  60.14 
 
 
194 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445554  hitchhiker  0.00820964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4148  iron-sulfur cluster-binding protein  44.87 
 
 
291 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1174  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  56.43 
 
 
209 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0937  electron transport complex protein RnfB  55.63 
 
 
192 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.556541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2966  electron transport complex protein RnfB  58.52 
 
 
188 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1035  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  51.35 
 
 
190 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  47.51 
 
 
404 aa  147  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2794  hypothetical protein  43.06 
 
 
204 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2940  hypothetical protein  43.06 
 
 
204 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2400  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB  56.12 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.942423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1403  electron transport complex protein RnfB  53.57 
 
 
191 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466807  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2354  electron transport complex protein RnfB  51.77 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.720002  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  50.71 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  45.45 
 
 
199 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  50.71 
 
 
189 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  50 
 
 
199 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  50 
 
 
199 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2240  electron transport complex protein RnfB  50 
 
 
190 aa  138  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000443884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1895  electron transport complex protein RnfB  48.23 
 
 
207 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2198  electron transport complex protein RnfB  47.95 
 
 
189 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.401389  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2007  electron transport complex protein RnfB  48.23 
 
 
207 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2067  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50.71 
 
 
189 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0305749  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  50 
 
 
193 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2253  electron transport complex protein RnfB  48.23 
 
 
188 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0146582  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  50 
 
 
204 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  50 
 
 
204 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  50 
 
 
193 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  48.57 
 
 
194 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  50 
 
 
204 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1639  electron transport complex protein RnfB  49.06 
 
 
188 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  50 
 
 
193 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01788  ferredoxin  52.82 
 
 
142 aa  135  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102822  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1864  electron transport complex protein RnfB  52.34 
 
 
205 aa  135  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.164914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18930  electron transport complex protein RnfB  49.38 
 
 
188 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000143693  normal  0.123767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2557  electron transport complex protein RnfB  48.94 
 
 
189 aa  134  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1917  electron transport complex protein RnfB  49.29 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1680  ferredoxin  53.49 
 
 
139 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1754  ferredoxin  53.49 
 
 
139 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2928  ferredoxin  53.91 
 
 
137 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2043  electron transport complex protein RnfB  50 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0243874  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  49.29 
 
 
197 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0815  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  52.98 
 
 
186 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.783937 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0307  electron transport complex protein  42.13 
 
 
213 aa  131  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1884  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.13 
 
 
213 aa  131  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  52.34 
 
 
195 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  48.57 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  50.35 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1817  electron transport complex protein RnfB  47.52 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0338518  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19260  electron transport complex protein RnfB  48.43 
 
 
187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772376  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1820  electron transport complex protein RnfB  48.23 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1836  electron transport complex protein RnfB  47.52 
 
 
192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.912519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>