More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0264 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0264  ferredoxin  100 
 
 		 282 aa  564  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1322  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.54 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0084  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  39.61 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0376016  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0533  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  43.01 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1379  ferredoxin  40.3 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000430002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1086  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0696553 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0347  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.58 
 
 		 269 aa  201  8e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.16 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0499  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.37 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156783  hitchhiker  0.0000260777 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.76 
 
 		 266 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1309  ferredoxin  38.34 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.510214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1528  ferredoxin  38.34 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1243  ferredoxin  39.77 
 
 		 303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1154  ferredoxin  38.43 
 
 		 277 aa  182  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.445743 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0067  Fe-S cluster domain-containing protein  38.37 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.730786  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1321  ferredoxin  35.69 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0586  ferredoxin  37.12 
 
 		 289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0989  ferredoxin  36.19 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2435  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  39.92 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2474  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.94 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0216  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.36 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00676353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1955  ferredoxin  36.02 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.356544  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0517  ferredoxin  37.06 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0546  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  36.64 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.54841e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2694  ferredoxin  37.01 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378888 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0694  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.5 
 
 		 267 aa  162  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0303  ferredoxin  37.08 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.606306 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2511  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  43.4 
 
 		 672 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0311  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.91 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.287038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  39.46 
 
 		 699 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1894  ferredoxin  38.4 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000460706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1895  electron transport complex protein RnfB  31.44 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2007  electron transport complex protein RnfB  31.44 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2253  electron transport complex protein RnfB  31.44 
 
 		 188 aa  102  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2198  electron transport complex protein RnfB  32.98 
 
 		 189 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.401389  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01598  electron transport complex protein RnfB  32.31 
 
 		 192 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000941545  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2013  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.31 
 
 		 192 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144398  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02730  electron transport complex protein RnfB  30.39 
 
 		 193 aa  95.9  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000653403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2001  electron transport complex protein RnfB  32.31 
 
 		 192 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000498524  normal  0.338717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01588  hypothetical protein  32.31 
 
 		 192 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1704  electron transport complex protein RnfB  32.31 
 
 		 192 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2340  electron transport complex protein RnfB  32.31 
 
 		 192 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.297329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1571  electron transport complex protein RnfB  32.31 
 
 		 192 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1836  electron transport complex protein RnfB  32.31 
 
 		 192 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.912519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2966  electron transport complex protein RnfB  32.62 
 
 		 188 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2354  electron transport complex protein RnfB  31.4 
 
 		 189 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.720002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1568  electron transport complex protein RnfB  33.16 
 
 		 192 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0321479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1628  electron transport complex protein RnfB  33.16 
 
 		 192 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0262939  normal  0.320495 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1884  electron transport complex protein RnfB  33.16 
 
 		 192 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1556  electron transport complex protein RnfB  31.91 
 
 		 192 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0733084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1716  electron transport complex protein RnfB  31.91 
 
 		 192 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.270473  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1817  electron transport complex protein RnfB  31.28 
 
 		 192 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0338518  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  28.19 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  30.32 
 
 		 188 aa  89.7  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1820  electron transport complex protein RnfB  31.15 
 
 		 192 aa  90.1  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173992 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1791  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.69 
 
 		 194 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445554  hitchhiker  0.00820964 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1035  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.02 
 
 		 190 aa  89  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2557  electron transport complex protein RnfB  31.02 
 
 		 189 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2155  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.73 
 
 		 196 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  30.05 
 
 		 183 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  30.11 
 
 		 197 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2240  electron transport complex protein RnfB  31.77 
 
 		 190 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000443884 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  29.23 
 
 		 184 aa  86.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2043  electron transport complex protein RnfB  32.95 
 
 		 189 aa  85.9  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0243874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0689  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.22 
 
 		 181 aa  85.9  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0763573  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  29.63 
 
 		 193 aa  85.5  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2823  electron transport complex, B subunit  31.22 
 
 		 182 aa  84.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  29.63 
 
 		 193 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  29.63 
 
 		 193 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2024  electron transport complex protein RnfB  31.4 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  29.26 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  29.26 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2627  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  28.87 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2324  electron transport complex protein RnfB  31.98 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  29.26 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  29.79 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  28.72 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  28.72 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  30.85 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  27.27 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  29.41 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1917  electron transport complex protein RnfB  29.48 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0464  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.3 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0463817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  30 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1786  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.48 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  28.8 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2173  electron transport complex protein RnfB  29.47 
 
 		 193 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0287954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2067  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.58 
 
 		 189 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0305749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0720  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.09 
 
 		 681 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340491  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1174  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.76 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1864  electron transport complex protein RnfB  31.18 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.164914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1493  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  29.95 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1544  electron transport complex protein RnfB  30.22 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1403  electron transport complex protein RnfB  31.98 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50970  Electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.98 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0817561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1162  electron transport complex protein RnfB  28.72 
 
 		 180 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18930  electron transport complex protein RnfB  30.41 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000143693  normal  0.123767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2400  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB  30.59 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.942423 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1006  ferredoxin  32.9 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.110987 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1015  ferredoxin  30.32 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0219422  normal  0.72194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>