73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3183 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3183  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  100 
 
 		 446 aa  910    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2564  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  59.6 
 
 		 450 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0634  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  52.8 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.99963  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_603  carbon-monoxide dehydrogenase, corrinoid/iron-sulfur protein, gamma subunit  52.35 
 
 		 448 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0699  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  51.68 
 
 		 448 aa  480  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0665  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  51.68 
 
 		 448 aa  480  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1272  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.07 
 
 		 442 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2796  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  43.82 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0337  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.72 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1201  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.84 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0872  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40.77 
 
 		 443 aa  362  9e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0112  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  42.25 
 
 		 452 aa  361  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1678  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  37.14 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.910925  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0222  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  36.92 
 
 		 457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.498309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0800  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  36.92 
 
 		 457 aa  319  6e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  38.29 
 
 		 444 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0306  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  36.04 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.135337  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1194  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  39.05 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521851  normal  0.0279063 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1369  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  38.04 
 
 		 476 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.78916  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0686  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  33.19 
 
 		 476 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0211  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  31.58 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0863  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  33.26 
 
 		 468 aa  262  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0429  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  34.64 
 
 		 469 aa  256  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.400713  normal  0.82732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0199  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  34.64 
 
 		 469 aa  256  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0287  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  32.83 
 
 		 470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0876  hypothetical protein  26.19 
 
 		 342 aa  67  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0987304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0376  CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase gamma subunit (corrinoid Fe-S protein)-like protein  30.89 
 
 		 346 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1034  hypothetical protein  30.08 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2880  Fe-S cluster domain-containing protein  53.06 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0422  hypothetical protein  26.4 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3600  Fe-S cluster domain-containing protein  46.94 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1440  hypothetical protein  28.8 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.343868  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3091  CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase gamma subunit (corrinoid Fe-S protein)-like protein  32.95 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3405  Fe-S cluster domain protein  41.67 
 
 		 266 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0480  CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase gamma subunit (corrinoid Fe-S protein)-like protein  27.87 
 
 		 318 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1240  hypothetical protein  34.09 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.898012  normal  0.0596193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1183  CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase gamma subunit (corrinoid Fe-S protein)-like protein  32.95 
 
 		 340 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3052  Fe-S cluster domain protein  43.75 
 
 		 266 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.471844  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2213  putative Fe-S cluster  51.11 
 
 		 171 aa  53.9  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0469762  hitchhiker  0.00385704 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1680  ferredoxin  38.46 
 
 		 139 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01788  ferredoxin  40 
 
 		 142 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102822  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1754  ferredoxin  38.46 
 
 		 139 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1721  hypothetical protein  51.35 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0335  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  41.67 
 
 		 152 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2170  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.38 
 
 		 221 aa  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.211409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1236  ferredoxin  39.06 
 
 		 279 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2096  ferredoxin  39.68 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2921  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  34.43 
 
 		 154 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.916972  hitchhiker  0.000246465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1288  Fe-S cluster domain-containing protein  38.78 
 
 		 262 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.323345  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  42.86 
 
 		 188 aa  47.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0978  Fe-S cluster domain-containing protein  36.05 
 
 		 152 aa  47.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  35.38 
 
 		 183 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3310  ferredoxin  37.5 
 
 		 279 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3619  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  36.36 
 
 		 238 aa  47  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111565  normal  0.0672308 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1915  Fe-S cluster domain-containing protein  44.44 
 
 		 270 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.825749  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1535  Fe-S cluster domain-containing protein  42.86 
 
 		 276 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.02631  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2064  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.38 
 
 		 217 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.295108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2975  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  36 
 
 		 224 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.38 
 
 		 212 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2928  ferredoxin  39.22 
 
 		 137 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1162  electron transport complex protein RnfB  42.86 
 
 		 180 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1930  ferredoxin  37.5 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1023  ferredoxin  37.5 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0842  ferredoxin  37.5 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.736914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1176  ferredoxin  37.5 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1184  ferredoxin  37.5 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0306  ferredoxin  37.5 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.22 
 
 		 291 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1337  ferredoxin  37.5 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2137  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.82 
 
 		 214 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1721  Fe-S cluster domain protein  36 
 
 		 266 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  38.78 
 
 		 178 aa  43.5  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0156  Fe-S cluster domain-containing protein  42.86 
 
 		 238 aa  43.5  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>