55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0872 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0872  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  100 
 
 		 443 aa  894    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1272  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  62.84 
 
 		 442 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0337  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  60.9 
 
 		 446 aa  542  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1201  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  53.29 
 
 		 446 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2796  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  48.3 
 
 		 440 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0699  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.07 
 
 		 448 aa  415  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_603  carbon-monoxide dehydrogenase, corrinoid/iron-sulfur protein, gamma subunit  44.84 
 
 		 448 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0634  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.74 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.99963  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0665  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.07 
 
 		 448 aa  415  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2564  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.07 
 
 		 450 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3183  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40.77 
 
 		 446 aa  362  9e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40.41 
 
 		 444 aa  340  4e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1194  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  41.53 
 
 		 444 aa  339  5e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521851  normal  0.0279063 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0112  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  39.51 
 
 		 452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1678  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  36.3 
 
 		 457 aa  326  5e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.910925  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0222  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  35.43 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.498309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0800  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  35.22 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0306  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  36.24 
 
 		 457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.135337  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1369  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  35.87 
 
 		 476 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.78916  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0686  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  33.84 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0211  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  30.96 
 
 		 489 aa  262  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0863  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  30.28 
 
 		 468 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0287  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  30.3 
 
 		 470 aa  247  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0429  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  31.82 
 
 		 469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.400713  normal  0.82732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0199  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  31.82 
 
 		 469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0876  hypothetical protein  29.41 
 
 		 342 aa  67  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0987304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0376  CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase gamma subunit (corrinoid Fe-S protein)-like protein  31.97 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3600  Fe-S cluster domain-containing protein  49.06 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2880  Fe-S cluster domain-containing protein  54 
 
 		 173 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0422  hypothetical protein  30.08 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3052  Fe-S cluster domain protein  47.17 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.471844  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0480  CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase gamma subunit (corrinoid Fe-S protein)-like protein  30.33 
 
 		 318 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2213  putative Fe-S cluster  53.33 
 
 		 171 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0469762  hitchhiker  0.00385704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3405  Fe-S cluster domain protein  50 
 
 		 266 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1034  hypothetical protein  28 
 
 		 320 aa  54.7  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1440  hypothetical protein  28.81 
 
 		 325 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.343868  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0335  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  55 
 
 		 152 aa  53.1  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1288  Fe-S cluster domain-containing protein  43.24 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.323345  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1721  hypothetical protein  45.95 
 
 		 265 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1915  Fe-S cluster domain-containing protein  45.65 
 
 		 270 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.825749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1240  hypothetical protein  28.81 
 
 		 323 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.898012  normal  0.0596193 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1535  Fe-S cluster domain-containing protein  44.07 
 
 		 276 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.02631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1721  Fe-S cluster domain protein  41.18 
 
 		 266 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2921  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  38.3 
 
 		 154 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.916972  hitchhiker  0.000246465 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1183  CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase gamma subunit (corrinoid Fe-S protein)-like protein  25.41 
 
 		 340 aa  47.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3091  CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase gamma subunit (corrinoid Fe-S protein)-like protein  25.41 
 
 		 322 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1337  ferredoxin  51.22 
 
 		 316 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1930  ferredoxin  51.22 
 
 		 316 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0971  ferredoxin  51.22 
 
 		 282 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0978  Fe-S cluster domain-containing protein  39.73 
 
 		 152 aa  43.1  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0306  ferredoxin  51.22 
 
 		 290 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1184  ferredoxin  51.22 
 
 		 290 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1176  ferredoxin  51.22 
 
 		 290 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0842  ferredoxin  51.22 
 
 		 290 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.736914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1023  ferredoxin  51.22 
 
 		 290 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>