60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_603 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0634  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  89.29 
 
 		 448 aa  833    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.99963  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_603  carbon-monoxide dehydrogenase, corrinoid/iron-sulfur protein, gamma subunit  100 
 
 		 448 aa  926    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0665  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  96.65 
 
 		 448 aa  893    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0699  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  96.65 
 
 		 448 aa  893    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3183  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  52.35 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2564  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  50.11 
 
 		 450 aa  484  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0337  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  47.98 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1272  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.84 
 
 		 442 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0872  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.84 
 
 		 443 aa  413  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0112  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.14 
 
 		 452 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1201  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  46.17 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2796  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  43.24 
 
 		 440 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  37.75 
 
 		 444 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1194  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  41.22 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521851  normal  0.0279063 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0222  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  38.7 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.498309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0306  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  38.04 
 
 		 457 aa  327  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.135337  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0800  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  38.18 
 
 		 457 aa  327  3e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1678  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  37.83 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.910925  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1369  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  37.83 
 
 		 476 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.78916  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0686  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  34.64 
 
 		 476 aa  302  9e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0863  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  34.71 
 
 		 468 aa  275  9e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0211  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  33.33 
 
 		 489 aa  273  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0287  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  30.54 
 
 		 470 aa  253  6e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0429  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  32.97 
 
 		 469 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.400713  normal  0.82732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0199  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  32.97 
 
 		 469 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0876  hypothetical protein  29.27 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0987304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1034  hypothetical protein  31.09 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0376  CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase gamma subunit (corrinoid Fe-S protein)-like protein  29.03 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1440  hypothetical protein  31.09 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.343868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0480  CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase gamma subunit (corrinoid Fe-S protein)-like protein  29.27 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1183  CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase gamma subunit (corrinoid Fe-S protein)-like protein  28.33 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0422  hypothetical protein  27.5 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3091  CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase gamma subunit (corrinoid Fe-S protein)-like protein  28.33 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3052  Fe-S cluster domain protein  44.9 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.471844  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3405  Fe-S cluster domain protein  44.9 
 
 		 266 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2213  putative Fe-S cluster  54.35 
 
 		 171 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0469762  hitchhiker  0.00385704 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1240  hypothetical protein  29.27 
 
 		 323 aa  57  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.898012  normal  0.0596193 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3600  Fe-S cluster domain-containing protein  44.23 
 
 		 173 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2880  Fe-S cluster domain-containing protein  47.06 
 
 		 173 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1721  Fe-S cluster domain protein  38.46 
 
 		 266 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1721  hypothetical protein  47.62 
 
 		 265 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  40.74 
 
 		 188 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1535  Fe-S cluster domain-containing protein  39.22 
 
 		 276 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.02631  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0978  Fe-S cluster domain-containing protein  41.38 
 
 		 152 aa  48.5  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1288  Fe-S cluster domain-containing protein  41.86 
 
 		 262 aa  47.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.323345  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0335  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  43.4 
 
 		 152 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  40.82 
 
 		 183 aa  47  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  37.04 
 
 		 178 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2170  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.81 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.211409 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2921  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  40.82 
 
 		 154 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.916972  hitchhiker  0.000246465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1162  electron transport complex protein RnfB  37.29 
 
 		 180 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.1 
 
 		 291 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1915  Fe-S cluster domain-containing protein  35.29 
 
 		 270 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.825749  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0216  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.67 
 
 		 282 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00676353  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2940  hypothetical protein  51.35 
 
 		 204 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2794  hypothetical protein  51.35 
 
 		 204 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1754  ferredoxin  44.44 
 
 		 139 aa  43.1  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0667  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit delta  22.13 
 
 		 313 aa  43.1  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0701  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit delta  22.13 
 
 		 313 aa  43.1  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0067  Fe-S cluster domain-containing protein  42.86 
 
 		 293 aa  43.1  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.730786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>