42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2880 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2880  Fe-S cluster domain-containing protein  100 
 
 		 173 aa  361  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3600  Fe-S cluster domain-containing protein  58.72 
 
 		 173 aa  225  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2213  putative Fe-S cluster  36.18 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0469762  hitchhiker  0.00385704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1721  hypothetical protein  37.17 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1288  Fe-S cluster domain-containing protein  27.78 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.323345  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0872  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  54 
 
 		 443 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3183  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  53.06 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1272  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  50 
 
 		 442 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_603  carbon-monoxide dehydrogenase, corrinoid/iron-sulfur protein, gamma subunit  47.06 
 
 		 448 aa  54.7  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0634  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  47.06 
 
 		 448 aa  54.3  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.99963  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0686  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  48.94 
 
 		 476 aa  54.3  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0699  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  47.06 
 
 		 448 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0337  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  51.16 
 
 		 446 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3405  Fe-S cluster domain protein  43.75 
 
 		 266 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  46 
 
 		 444 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1369  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.19 
 
 		 476 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.78916  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_002936  DET0665  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  47.06 
 
 		 448 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2564  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44 
 
 		 450 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1194  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  46 
 
 		 444 aa  53.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521851  normal  0.0279063 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0800  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  43.86 
 
 		 457 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3052  Fe-S cluster domain protein  45.83 
 
 		 266 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.471844  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2921  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  44.68 
 
 		 154 aa  51.2  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.916972  hitchhiker  0.000246465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0335  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  52.38 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0222  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  42.11 
 
 		 457 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.498309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1678  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  42.11 
 
 		 457 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.910925  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0211  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  46.51 
 
 		 489 aa  49.7  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2796  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  43.75 
 
 		 440 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1915  Fe-S cluster domain-containing protein  33.96 
 
 		 270 aa  48.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.825749  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0156  Fe-S cluster domain-containing protein  40 
 
 		 238 aa  47.4  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1201  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  46.34 
 
 		 446 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0978  Fe-S cluster domain-containing protein  47.06 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0682  Fe-S cluster domain-containing protein  41.07 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0287  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40 
 
 		 470 aa  44.7  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0429  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40 
 
 		 469 aa  44.7  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.400713  normal  0.82732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0199  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40 
 
 		 469 aa  44.7  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0306  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  38.6 
 
 		 457 aa  44.7  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.135337  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0863  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  38.3 
 
 		 468 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0112  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  41.67 
 
 		 452 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1402  Fe-S cluster domain-containing protein  41.07 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1274  Fe-S cluster domain-containing protein  41.07 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0067  Fe-S cluster domain-containing protein  38.98 
 
 		 293 aa  41.6  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.730786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1535  Fe-S cluster domain-containing protein  48.57 
 
 		 276 aa  41.2  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.02631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>