29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0682 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0682  Fe-S cluster domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1274  Fe-S cluster domain-containing protein  96.35 
 
 
219 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.853386  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1402  Fe-S cluster domain-containing protein  94.06 
 
 
219 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1282  Fe-S cluster domain-containing protein  76.26 
 
 
218 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0156  Fe-S cluster domain-containing protein  57.14 
 
 
238 aa  270  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1457  putative Fe-S cluster protein  45.16 
 
 
208 aa  207  8e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141029  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0683  Fe-S cluster domain-containing protein  49.53 
 
 
203 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2979  putative Fe-S cluster  31.84 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0501  hypothetical protein  28.31 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2736  Fe-S cluster domain protein  29.7 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.816152 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0109  Fe-S cluster domain-containing protein  28.18 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.247624  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1792  Fe-S cluster domain protein  29.13 
 
 
276 aa  62  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2115  Fe-S cluster domain-containing protein  25.34 
 
 
204 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1069  putative Fe-S cluster  28.07 
 
 
241 aa  58.5  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0171993  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1369  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  41.07 
 
 
476 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.78916  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.24 
 
 
266 aa  48.5  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2921  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  41.54 
 
 
154 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.916972  hitchhiker  0.000246465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0335  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  40.98 
 
 
152 aa  45.8  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2880  Fe-S cluster domain-containing protein  41.07 
 
 
173 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.3 
 
 
331 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0084  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  52.78 
 
 
271 aa  45.1  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0376016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3600  Fe-S cluster domain-containing protein  44.19 
 
 
173 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1573  Fe-S cluster domain-containing protein  39.66 
 
 
92 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2435  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  43.48 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568216  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1379  ferredoxin  45 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000430002  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0686  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  33.93 
 
 
476 aa  42.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0989  ferredoxin  46.34 
 
 
279 aa  42.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2213  putative Fe-S cluster  48.84 
 
 
171 aa  42.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0469762  hitchhiker  0.00385704 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1086  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.35 
 
 
286 aa  42  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0696553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>