51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1457 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1457  putative Fe-S cluster protein  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141029  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0683  Fe-S cluster domain-containing protein  54.15 
 
 		 203 aa  245  4e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1274  Fe-S cluster domain-containing protein  45.62 
 
 		 219 aa  208  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0682  Fe-S cluster domain-containing protein  45.16 
 
 		 219 aa  207  8e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1402  Fe-S cluster domain-containing protein  45.62 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1282  Fe-S cluster domain-containing protein  47.89 
 
 		 218 aa  204  8e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0156  Fe-S cluster domain-containing protein  43.35 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2979  putative Fe-S cluster  29.36 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0501  hypothetical protein  30.19 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1792  Fe-S cluster domain protein  27.83 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2115  Fe-S cluster domain-containing protein  25.94 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0109  Fe-S cluster domain-containing protein  29.95 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.247624  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1069  putative Fe-S cluster  31.7 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0171993  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2736  Fe-S cluster domain protein  25.93 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.816152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02730  electron transport complex protein RnfB  43.1 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000653403  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0937  electron transport complex protein RnfB  39.06 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.556541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2966  electron transport complex protein RnfB  40.68 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2354  electron transport complex protein RnfB  35.29 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.720002  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  40.43 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  40.43 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  39.29 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  37.7 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1403  electron transport complex protein RnfB  40 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  39.29 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  40.43 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  40.43 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  40.43 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  37.5 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  40.43 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  40.43 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  40.43 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.37 
 
 		 404 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0211  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  33.87 
 
 		 489 aa  43.5  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1639  electron transport complex protein RnfB  39.66 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18930  electron transport complex protein RnfB  39.66 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000143693  normal  0.123767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2173  electron transport complex protein RnfB  42.55 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0287954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  40.43 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  42.55 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  38.3 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1544  electron transport complex protein RnfB  35.94 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831464 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0912  Fe-S cluster domain protein  33.33 
 
 		 443 aa  42.4  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2400  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB  37.29 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.942423 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  40.68 
 
 		 188 aa  42  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2557  electron transport complex protein RnfB  40.43 
 
 		 189 aa  42  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.11 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1864  electron transport complex protein RnfB  43.9 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.164914  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1379  ferredoxin  42.86 
 
 		 265 aa  41.6  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000430002  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2043  electron transport complex protein RnfB  42.55 
 
 		 189 aa  41.6  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0243874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  37.29 
 
 		 291 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2198  electron transport complex protein RnfB  32.81 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.401389  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0288  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein B  25.97 
 
 		 227 aa  41.2  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>