176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0335 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0335  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  100 
 
 
152 aa  310  3.9999999999999997e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2921  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  64.94 
 
 
154 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.916972  hitchhiker  0.000246465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0978  Fe-S cluster domain-containing protein  60.53 
 
 
152 aa  197  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1369  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.83 
 
 
476 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.78916  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0211  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  48.33 
 
 
489 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0287  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  52.54 
 
 
470 aa  69.3  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0560  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.85 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0863  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  47.46 
 
 
468 aa  67.8  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0199  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  47.06 
 
 
469 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287834  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0429  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  47.06 
 
 
469 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.400713  normal  0.82732 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1427  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.62 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0454615  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0686  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  39.66 
 
 
476 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0222  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  51.67 
 
 
457 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.498309  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2213  putative Fe-S cluster  49.12 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0469762  hitchhiker  0.00385704 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0345  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  49.38 
 
 
80 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0800  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  50 
 
 
457 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.15 
 
 
80 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.505071  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1678  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  51.67 
 
 
457 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.910925  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1288  Fe-S cluster domain-containing protein  41.38 
 
 
262 aa  61.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.323345  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 
202 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.150574  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0306  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  48.39 
 
 
457 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.135337  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0633  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.51 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  36.56 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3052  Fe-S cluster domain protein  51.85 
 
 
266 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.471844  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3405  Fe-S cluster domain protein  48.94 
 
 
266 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  35.48 
 
 
188 aa  53.9  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0850  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.32 
 
 
216 aa  53.9  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.223684  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0994  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.32 
 
 
216 aa  53.9  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0262542  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2794  hypothetical protein  34.34 
 
 
204 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1721  hypothetical protein  43.4 
 
 
265 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0872  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  55 
 
 
443 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3183  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  41.67 
 
 
446 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2705  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.18 
 
 
259 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1972  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.73 
 
 
229 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.555312 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0937  ferredoxin  32.32 
 
 
276 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0337  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  48.89 
 
 
446 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2940  hypothetical protein  34.34 
 
 
204 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  54.55 
 
 
444 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2106  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.67 
 
 
203 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  31.87 
 
 
183 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1006  ferredoxin  31.07 
 
 
268 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.110987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1174  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.11 
 
 
209 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2880  Fe-S cluster domain-containing protein  52.38 
 
 
173 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  26.32 
 
 
194 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4148  iron-sulfur cluster-binding protein  32.58 
 
 
291 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1786  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.04 
 
 
192 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1544  electron transport complex protein RnfB  30.77 
 
 
198 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831464 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01788  ferredoxin  32.22 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2198  electron transport complex protein RnfB  32.29 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.401389  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1162  electron transport complex protein RnfB  32.95 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2400  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB  32.61 
 
 
206 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.942423 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1791  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.82 
 
 
194 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445554  hitchhiker  0.00820964 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2627  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.23 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  30.85 
 
 
197 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1754  ferredoxin  32.61 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1272  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  52.63 
 
 
442 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000364956  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0937  electron transport complex protein RnfB  31.18 
 
 
192 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.556541  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1194  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  46.67 
 
 
444 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521851  normal  0.0279063 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1680  ferredoxin  32.61 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0156  Fe-S cluster domain-containing protein  41.82 
 
 
238 aa  48.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2928  ferredoxin  36.96 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0872  ferredoxin  30.1 
 
 
276 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  30.85 
 
 
198 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2796  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  57.89 
 
 
440 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1498  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  28.7 
 
 
230 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0634  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  46.51 
 
 
448 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.99963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18930  electron transport complex protein RnfB  31.87 
 
 
188 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000143693  normal  0.123767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3600  Fe-S cluster domain-containing protein  45.45 
 
 
173 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1201  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  55.26 
 
 
446 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2564  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.44 
 
 
450 aa  48.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30 
 
 
184 aa  48.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1236  ferredoxin  31.18 
 
 
279 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1402  Fe-S cluster domain-containing protein  40.98 
 
 
219 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0464  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  26.92 
 
 
228 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0463817  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_603  carbon-monoxide dehydrogenase, corrinoid/iron-sulfur protein, gamma subunit  43.4 
 
 
448 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0307  electron transport complex protein  31.18 
 
 
213 aa  47.8  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1884  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.18 
 
 
213 aa  47.8  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1274  Fe-S cluster domain-containing protein  42.62 
 
 
219 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.853386  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1403  electron transport complex protein RnfB  32.61 
 
 
191 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466807  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  29.79 
 
 
195 aa  47.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1639  electron transport complex protein RnfB  31.87 
 
 
188 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2170  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  28.42 
 
 
221 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.211409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2121  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.29 
 
 
335 aa  47.4  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412453  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0665  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  41.82 
 
 
448 aa  47  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0699  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  41.82 
 
 
448 aa  47  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1023  ferredoxin  29.79 
 
 
290 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0842  ferredoxin  29.79 
 
 
290 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.736914  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1184  ferredoxin  29.79 
 
 
290 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0306  ferredoxin  29.79 
 
 
290 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1930  ferredoxin  29.79 
 
 
316 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1337  ferredoxin  29.79 
 
 
316 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2096  ferredoxin  30.77 
 
 
291 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1176  ferredoxin  29.79 
 
 
290 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3619  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.61 
 
 
238 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111565  normal  0.0672308 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.58 
 
 
291 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2341  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  27.66 
 
 
232 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0747882  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2975  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  28.89 
 
 
224 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2966  electron transport complex protein RnfB  31.87 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0682  Fe-S cluster domain-containing protein  40.98 
 
 
219 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2376  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.58 
 
 
231 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.532877  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>