71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2564 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2564  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  100 
 
 		 450 aa  919    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3183  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  59.6 
 
 		 446 aa  548  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0699  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  50.78 
 
 		 448 aa  490  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0665  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  50.78 
 
 		 448 aa  490  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0634  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  50.56 
 
 		 448 aa  485  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.99963  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_603  carbon-monoxide dehydrogenase, corrinoid/iron-sulfur protein, gamma subunit  50.11 
 
 		 448 aa  488  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1272  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.74 
 
 		 442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0337  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  47.2 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2796  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.74 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0872  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.07 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1201  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.96 
 
 		 446 aa  382  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0112  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  42.51 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0222  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  37.8 
 
 		 457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.498309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  39.64 
 
 		 444 aa  319  6e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1678  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  37.36 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.910925  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0800  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  36.92 
 
 		 457 aa  315  8e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1194  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  38.89 
 
 		 444 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521851  normal  0.0279063 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0306  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  37.06 
 
 		 457 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.135337  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1369  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  33.77 
 
 		 476 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.78916  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0686  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  33.77 
 
 		 476 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0287  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  33.33 
 
 		 470 aa  276  5e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0211  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  32.7 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0199  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  33.69 
 
 		 469 aa  256  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0429  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  33.69 
 
 		 469 aa  256  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.400713  normal  0.82732 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0863  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  32.4 
 
 		 468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0876  hypothetical protein  28.46 
 
 		 342 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0987304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0376  CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase gamma subunit (corrinoid Fe-S protein)-like protein  29.27 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0422  hypothetical protein  28.69 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3600  Fe-S cluster domain-containing protein  52 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1034  hypothetical protein  29.41 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3405  Fe-S cluster domain protein  47.83 
 
 		 266 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1183  CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase gamma subunit (corrinoid Fe-S protein)-like protein  26.89 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3052  Fe-S cluster domain protein  45.65 
 
 		 266 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.471844  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3091  CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase gamma subunit (corrinoid Fe-S protein)-like protein  26.89 
 
 		 322 aa  54.7  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1440  hypothetical protein  26.05 
 
 		 325 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.343868  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2213  putative Fe-S cluster  53.33 
 
 		 171 aa  53.5  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0469762  hitchhiker  0.00385704 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2880  Fe-S cluster domain-containing protein  44 
 
 		 173 aa  53.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1240  hypothetical protein  26.89 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.898012  normal  0.0596193 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1721  hypothetical protein  47.62 
 
 		 265 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1535  Fe-S cluster domain-containing protein  46.94 
 
 		 276 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.02631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0480  CO dehydrogenase/acetyl-CoA synthase gamma subunit (corrinoid Fe-S protein)-like protein  26.89 
 
 		 318 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1754  ferredoxin  38.6 
 
 		 139 aa  50.8  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1680  ferredoxin  38.6 
 
 		 139 aa  50.8  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1288  Fe-S cluster domain-containing protein  42.55 
 
 		 262 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.323345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01788  ferredoxin  37.04 
 
 		 142 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1721  Fe-S cluster domain protein  35.85 
 
 		 266 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0335  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  44.44 
 
 		 152 aa  48.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2170  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.92 
 
 		 221 aa  47  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.211409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1915  Fe-S cluster domain-containing protein  45.65 
 
 		 270 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.825749  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  33.33 
 
 		 188 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1236  ferredoxin  38.1 
 
 		 279 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0156  Fe-S cluster domain-containing protein  36.92 
 
 		 238 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  37.29 
 
 		 183 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2921  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  38.3 
 
 		 154 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.916972  hitchhiker  0.000246465 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2975  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.71 
 
 		 224 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3463  putative PAS/PAC sensor protein  21.59 
 
 		 576 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0978  Fe-S cluster domain-containing protein  40.82 
 
 		 152 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  40.82 
 
 		 178 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2940  hypothetical protein  54.05 
 
 		 204 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0683  Fe-S cluster domain-containing protein  48.72 
 
 		 203 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2096  ferredoxin  38.71 
 
 		 291 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3619  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.29 
 
 		 238 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111565  normal  0.0672308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3310  ferredoxin  36.51 
 
 		 279 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2064  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.92 
 
 		 217 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.295108 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2794  hypothetical protein  54.05 
 
 		 204 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1791  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.95 
 
 		 194 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445554  hitchhiker  0.00820964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0937  electron transport complex protein RnfB  44.9 
 
 		 192 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.556541  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.92 
 
 		 212 aa  43.9  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1174  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.95 
 
 		 209 aa  43.9  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1162  electron transport complex protein RnfB  43.75 
 
 		 180 aa  43.9  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2928  ferredoxin  35.29 
 
 		 137 aa  43.5  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>