21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_602 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_602  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0698  hypothetical protein  97.2 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0664  hypothetical protein  97.2 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0633  hypothetical protein  80.75 
 
 		 214 aa  355  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0660208  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0446  hypothetical protein  38.46 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3721  hypothetical protein  33.51 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000218431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1693  hypothetical protein  34.23 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1159  hypothetical protein  39.46 
 
 		 214 aa  95.1  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000681743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1614  hypothetical protein  31.82 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000204852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4098  hypothetical protein  29.57 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2548  hypothetical protein  30.68 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.477567 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1302  hypothetical protein  29.11 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000234521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2562  hypothetical protein  28.65 
 
 		 201 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221792  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1269  hypothetical protein  30.67 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388036  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1990  hypothetical protein  29.33 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0256208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1719  hypothetical protein  33.33 
 
 		 369 aa  65.1  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176072  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1915  Fe-S cluster domain-containing protein  24.31 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.825749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3052  Fe-S cluster domain protein  22.8 
 
 		 266 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.471844  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3405  Fe-S cluster domain protein  23.24 
 
 		 266 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1721  Fe-S cluster domain protein  22.22 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1535  Fe-S cluster domain-containing protein  26.95 
 
 		 276 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.02631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>