19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1719 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1719  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  739    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176072  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4098  hypothetical protein  32.66 
 
 
218 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0446  hypothetical protein  32.43 
 
 
205 aa  89.4  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1269  hypothetical protein  28.4 
 
 
209 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1302  hypothetical protein  28.25 
 
 
203 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1693  hypothetical protein  33.13 
 
 
204 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1159  hypothetical protein  37.11 
 
 
214 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000681743  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0633  hypothetical protein  36.28 
 
 
214 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0660208  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0698  hypothetical protein  36.19 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0664  hypothetical protein  36.19 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_602  hypothetical protein  36.19 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3721  hypothetical protein  34.91 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000218431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2562  hypothetical protein  29.41 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1614  hypothetical protein  26.01 
 
 
217 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000204852  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2548  hypothetical protein  28.3 
 
 
217 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.477567 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0691  hypothetical protein  38.98 
 
 
84 aa  49.7  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.278327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3052  Fe-S cluster domain protein  22.38 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.471844  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1717  hypothetical protein  33.96 
 
 
77 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0774344  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1915  Fe-S cluster domain-containing protein  24.65 
 
 
270 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.825749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>