116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0316 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  655    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  43.17 
 
 
377 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  42.54 
 
 
369 aa  272  7e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  41.59 
 
 
368 aa  269  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  42.77 
 
 
377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  41.82 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  42.27 
 
 
344 aa  248  8e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  40.95 
 
 
359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  36.39 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  36.28 
 
 
361 aa  188  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  34.89 
 
 
339 aa  186  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  32.2 
 
 
335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  32.7 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  30.19 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  31.37 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  30.19 
 
 
343 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  30.19 
 
 
343 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  30.19 
 
 
343 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  31.03 
 
 
343 aa  155  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  30.41 
 
 
343 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  33.23 
 
 
343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  30.41 
 
 
343 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  32.6 
 
 
380 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  32.03 
 
 
392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  30.98 
 
 
335 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  30.46 
 
 
349 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  32.7 
 
 
343 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  33.75 
 
 
377 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  33.75 
 
 
376 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  33.12 
 
 
375 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  29.87 
 
 
315 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  28.3 
 
 
318 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  27.68 
 
 
390 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  30.35 
 
 
323 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  26.75 
 
 
329 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  29.67 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  25.24 
 
 
330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  27.91 
 
 
330 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  27.91 
 
 
330 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  27.91 
 
 
330 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  29.21 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  29.36 
 
 
375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  27.07 
 
 
333 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  28.4 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  27.65 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  26.75 
 
 
330 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  29.52 
 
 
325 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  26.88 
 
 
402 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  28.44 
 
 
335 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  27.9 
 
 
343 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  24.76 
 
 
330 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  28.25 
 
 
328 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  24.76 
 
 
330 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  24.76 
 
 
330 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  27.22 
 
 
384 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  27.16 
 
 
331 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  23.08 
 
 
367 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  25.53 
 
 
346 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  25.57 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  27.24 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  24.6 
 
 
324 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  25.62 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  25.24 
 
 
364 aa  89  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  25 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  26.33 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  24.16 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  24.16 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  24.16 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  24.78 
 
 
349 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  25.38 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  22.75 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  24.92 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  24.17 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  28.06 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  23.9 
 
 
380 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  24 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  24.58 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  29.08 
 
 
679 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  23.81 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  24.31 
 
 
771 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  24.91 
 
 
1006 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02470  hypothetical protein  30.89 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  22.32 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  22.13 
 
 
770 aa  63.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  24.17 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  24.17 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  23.49 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1140  hypothetical protein  26.58 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0783144  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39940  hypothetical protein  23.87 
 
 
382 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  22.5 
 
 
271 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  23.65 
 
 
817 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  22.57 
 
 
968 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  22.43 
 
 
672 aa  55.8  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  25.14 
 
 
989 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3521  hypothetical protein  21.41 
 
 
353 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  22.63 
 
 
297 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  22.63 
 
 
279 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  23.05 
 
 
331 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  22.75 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  23.74 
 
 
684 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>