73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0884 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  814    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  38.08 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  37.4 
 
 		 364 aa  173  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  26.88 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  28.78 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  26.25 
 
 		 330 aa  102  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  27.24 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  29.04 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  26.69 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  29.41 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  27.33 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  27.84 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39940  hypothetical protein  30.23 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  28.18 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  29.91 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  30.79 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  30.07 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  27.38 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  28.97 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  28.34 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  31.18 
 
 		 730 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  27.25 
 
 		 679 aa  73.9  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  29.15 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  29.69 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  29.35 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  29.83 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  29.35 
 
 		 343 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  29.35 
 
 		 343 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  28.67 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  29.35 
 
 		 343 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  29.35 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  30.77 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  30.43 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  25.89 
 
 		 770 aa  70.1  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  28.45 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  34.92 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  29.33 
 
 		 324 aa  67  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  38.39 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  25.5 
 
 		 762 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  26.78 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  28.01 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  27.93 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  29.19 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  31.56 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  31.15 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  31.56 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  40.2 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  31.56 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  27.66 
 
 		 342 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  34.81 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  35.56 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  26.01 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  37.5 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  30.6 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  35.77 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  23.89 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  29.51 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  34.35 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  28.23 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  28.23 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  28.23 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  20 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  35 
 
 		 1006 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  27.99 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  23.57 
 
 		 771 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  30.38 
 
 		 336 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  26.28 
 
 		 332 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  29.69 
 
 		 710 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  27.46 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  27.4 
 
 		 817 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  28.93 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  25.27 
 
 		 330 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  28.27 
 
 		 329 aa  43.1  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>