214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1528 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  100 
 
 
771 aa  1582    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  44.11 
 
 
770 aa  625  1e-178  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  38.93 
 
 
762 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  36.08 
 
 
817 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.09 
 
 
371 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1968  hypothetical protein  32.94 
 
 
726 aa  345  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  32.89 
 
 
710 aa  345  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1749  hypothetical protein  32.64 
 
 
709 aa  343  9e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1796  hypothetical protein  32.64 
 
 
709 aa  343  9e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284537  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1730  hypothetical protein  32.64 
 
 
709 aa  343  9e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  29.76 
 
 
730 aa  332  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11385  hypothetical protein  30.64 
 
 
715 aa  321  3e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0566  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.7 
 
 
674 aa  302  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297383  normal  0.30294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0204  hypothetical protein  27.69 
 
 
711 aa  300  6e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1081  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.47 
 
 
370 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.08 
 
 
387 aa  153  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  23.45 
 
 
679 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  20.93 
 
 
989 aa  115  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  25.84 
 
 
351 aa  100  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  21.53 
 
 
968 aa  100  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  24.45 
 
 
672 aa  99.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  22.66 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1624  molybdopterin biosynthesis protein MoeY  22.76 
 
 
369 aa  76.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00849574  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  21.98 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  22.43 
 
 
684 aa  70.5  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  25.94 
 
 
390 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.85 
 
 
253 aa  66.6  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1623  hypothetical protein  31.69 
 
 
295 aa  65.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  22.41 
 
 
377 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  23.02 
 
 
330 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  26.32 
 
 
344 aa  63.9  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  20 
 
 
1006 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  22.63 
 
 
377 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  21.07 
 
 
329 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  24.03 
 
 
318 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  29.55 
 
 
330 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  29.55 
 
 
330 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  24.39 
 
 
336 aa  62  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  23.66 
 
 
332 aa  61.6  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  28.66 
 
 
346 aa  61.2  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  24.31 
 
 
325 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0191  hypothetical protein  34.71 
 
 
291 aa  59.7  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.409062  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.08 
 
 
250 aa  59.7  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  23.84 
 
 
330 aa  58.9  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  22.7 
 
 
349 aa  59.3  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  22.61 
 
 
331 aa  58.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.79 
 
 
252 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  30.5 
 
 
275 aa  58.2  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  22.15 
 
 
330 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1157  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.63 
 
 
215 aa  57.8  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  22.15 
 
 
330 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  22.15 
 
 
330 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2502  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.59 
 
 
292 aa  57.4  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  26.4 
 
 
254 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1178  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.33 
 
 
267 aa  57.4  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  23.86 
 
 
392 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  22.95 
 
 
361 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  26.25 
 
 
255 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  29.79 
 
 
275 aa  56.2  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1525  hypothetical protein  31.21 
 
 
287 aa  56.6  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.79 
 
 
275 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  30.08 
 
 
318 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  30.08 
 
 
318 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  22.62 
 
 
320 aa  55.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  30.08 
 
 
318 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  23.34 
 
 
369 aa  55.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  26.25 
 
 
255 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  22.9 
 
 
315 aa  55.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.43 
 
 
403 aa  54.7  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  26.67 
 
 
327 aa  54.7  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1276  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.78 
 
 
283 aa  54.3  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0911002  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.62 
 
 
255 aa  54.3  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12362  hypothetical protein  22.9 
 
 
318 aa  54.3  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0151  hypothetical protein  33.61 
 
 
300 aa  53.9  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  24.66 
 
 
349 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.62 
 
 
255 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28 
 
 
242 aa  53.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  24.32 
 
 
342 aa  53.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  20.17 
 
 
368 aa  53.5  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  27.07 
 
 
332 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  30.53 
 
 
328 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.97 
 
 
272 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.94 
 
 
251 aa  52.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.27 
 
 
270 aa  52.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  26.67 
 
 
327 aa  52  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  24.24 
 
 
367 aa  52  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2396  hypothetical protein  27.66 
 
 
290 aa  51.6  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000837429  normal  0.548926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  25.47 
 
 
332 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.22 
 
 
259 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2046  hypothetical protein  27.21 
 
 
290 aa  51.2  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000420492  hitchhiker  0.0000188727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.62 
 
 
251 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  31.62 
 
 
247 aa  51.2  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0490  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.94 
 
 
220 aa  50.8  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.73 
 
 
256 aa  50.8  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  23.78 
 
 
255 aa  50.8  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.78 
 
 
255 aa  50.8  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000273518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.16 
 
 
254 aa  50.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  29.91 
 
 
236 aa  50.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.16 
 
 
244 aa  50.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2248  HesA/MoeB/ThiF family protein  28.77 
 
 
240 aa  49.7  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>