98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4994 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  647    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  68.92 
 
 
327 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  53.87 
 
 
331 aa  330  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  52.13 
 
 
332 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  51.23 
 
 
325 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  51.23 
 
 
325 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  51.23 
 
 
325 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  48.62 
 
 
335 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  48.62 
 
 
335 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  50.98 
 
 
331 aa  291  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  48.62 
 
 
335 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  52.12 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  52.12 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  52.12 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  47.81 
 
 
344 aa  271  7e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  36.81 
 
 
329 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  37.12 
 
 
325 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  34.06 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  39.44 
 
 
328 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  37.66 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  37.66 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  37.66 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  34.46 
 
 
330 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  34.14 
 
 
330 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  34.14 
 
 
330 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  31.91 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  36.02 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  35.33 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  35.33 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  35.33 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  35.35 
 
 
382 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  35.1 
 
 
380 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  34.27 
 
 
335 aa  129  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  34.63 
 
 
361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  31.85 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  31.69 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  35.02 
 
 
315 aa  113  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  31.45 
 
 
342 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  29.87 
 
 
335 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  32.09 
 
 
343 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  32.09 
 
 
343 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  32.09 
 
 
343 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  29.45 
 
 
380 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  32.09 
 
 
343 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  32.09 
 
 
343 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  32.09 
 
 
343 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  29.28 
 
 
335 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  32.09 
 
 
343 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  30.63 
 
 
324 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  30.56 
 
 
343 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  29.54 
 
 
330 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  28.66 
 
 
343 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  32.5 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  30.96 
 
 
273 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  31.14 
 
 
346 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  29.23 
 
 
349 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  29.23 
 
 
333 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  30.92 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  28.13 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  30.82 
 
 
375 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  33.75 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  30.98 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  30.82 
 
 
376 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  30.82 
 
 
377 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  31.76 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  29.77 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  28.22 
 
 
367 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  31.48 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  30.12 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  26.49 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  28.75 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  28.66 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  24.84 
 
 
339 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  51.22 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  26.83 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  25.17 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  26.65 
 
 
392 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  33.06 
 
 
390 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2618  hypothetical protein  36.96 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  36.96 
 
 
297 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  36.96 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  25.61 
 
 
368 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  23.05 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  22.77 
 
 
377 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  26.67 
 
 
771 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  28.04 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  24.44 
 
 
384 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  22.39 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  27.64 
 
 
355 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  32.98 
 
 
378 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  25 
 
 
375 aa  50.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  28.18 
 
 
989 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  29.17 
 
 
1006 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  28.33 
 
 
679 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  32.28 
 
 
364 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  26.53 
 
 
817 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.54 
 
 
248 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  24.91 
 
 
968 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>