107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5585 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  691    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  72.89 
 
 		 343 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  61.99 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  63.92 
 
 		 335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  62.39 
 
 		 343 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  62.08 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  61.77 
 
 		 343 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  61.77 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  61.16 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  61.16 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  61.77 
 
 		 343 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  61.16 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  60.8 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  45.93 
 
 		 361 aa  256  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  40.06 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  41.27 
 
 		 375 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  41.27 
 
 		 376 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  41.27 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  32.74 
 
 		 339 aa  186  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  37.54 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  39.87 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  39.29 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  32.7 
 
 		 318 aa  156  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  37.5 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  34.7 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  32.25 
 
 		 392 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  31.89 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  36.53 
 
 		 323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  33.96 
 
 		 369 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  31.27 
 
 		 377 aa  143  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  33.12 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  29.1 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  34.52 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  32.92 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  35.67 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  34.12 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  31.4 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  36.07 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  36.11 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  36.5 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  37.16 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  33.13 
 
 		 336 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  33.22 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  33.33 
 
 		 328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  34.29 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  34.11 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  30.51 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  34.95 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  33.03 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  32.31 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  32.72 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  32.72 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  32.26 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  31.71 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  32.21 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  33.33 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  30.67 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  31.4 
 
 		 367 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  29.79 
 
 		 375 aa  106  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  32.67 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  32.67 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  32.67 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  30.65 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  30.65 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  30.65 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  32.31 
 
 		 318 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  32.31 
 
 		 318 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  32.31 
 
 		 318 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  28.7 
 
 		 331 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  27.72 
 
 		 331 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  30.82 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  28.66 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  31.18 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  27 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  27.83 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  27.83 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  27.22 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  28.22 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  29.88 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  30.23 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  30.23 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  30.23 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  25.22 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  25.07 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1006 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1968  hypothetical protein  28.88 
 
 		 726 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  25.47 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  26.06 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  28.05 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  23.42 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  24.19 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  28.34 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  28.13 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  28.13 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  29.49 
 
 		 730 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  25.52 
 
 		 679 aa  60.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  29.17 
 
 		 989 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  28.23 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  25.7 
 
 		 817 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  43.33 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>