106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4061 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  710    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  45.92 
 
 
346 aa  259  7e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  46.33 
 
 
349 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  38.08 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  35.41 
 
 
361 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  36.1 
 
 
323 aa  153  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  33.05 
 
 
349 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  32.96 
 
 
332 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  35.56 
 
 
343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  34.08 
 
 
335 aa  136  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  35.67 
 
 
343 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  33.99 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  33.7 
 
 
343 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  33.92 
 
 
380 aa  133  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  33.73 
 
 
320 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  33.7 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  33.53 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  33.53 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  33.53 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  33.33 
 
 
331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  34.87 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  33.33 
 
 
333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  33.43 
 
 
343 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  33.43 
 
 
343 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  33.43 
 
 
343 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  33.43 
 
 
343 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  33.52 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  33.52 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  32.59 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  33.52 
 
 
330 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  33.43 
 
 
343 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  33.33 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  33.05 
 
 
330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  29.89 
 
 
342 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  34.21 
 
 
324 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  33.14 
 
 
328 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  32.36 
 
 
382 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  34.64 
 
 
318 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  30.79 
 
 
330 aa  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  31.4 
 
 
343 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  33.43 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  32 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  31.67 
 
 
375 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  31.28 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  31.28 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  31.64 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  33.53 
 
 
318 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  33.53 
 
 
318 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  33.53 
 
 
318 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  28.76 
 
 
342 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  29.71 
 
 
329 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  28.93 
 
 
344 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  31.69 
 
 
343 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  28.29 
 
 
331 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  30.03 
 
 
325 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  30.03 
 
 
325 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  30.03 
 
 
325 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  27.35 
 
 
339 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  34.64 
 
 
315 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  27.02 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  29.73 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  29.49 
 
 
332 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  24.31 
 
 
344 aa  92.8  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  28.13 
 
 
335 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  28.13 
 
 
335 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  23.08 
 
 
318 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  28.13 
 
 
335 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  27.93 
 
 
368 aa  89.4  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  27.54 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  22.78 
 
 
372 aa  87.4  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  27.59 
 
 
326 aa  86.3  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  25 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  27.79 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  27.79 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  27.79 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  25.46 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  29.16 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  21.08 
 
 
330 aa  75.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  26.74 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  23.98 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  29.17 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  27.61 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  25.98 
 
 
359 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  25.82 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  34.81 
 
 
402 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  24.8 
 
 
375 aa  60.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  30.09 
 
 
1006 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  23.78 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  20.95 
 
 
771 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  28.61 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  37.36 
 
 
271 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  40.54 
 
 
279 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  40.54 
 
 
297 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2618  hypothetical protein  40.54 
 
 
297 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  25.23 
 
 
679 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  28.48 
 
 
762 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  32.09 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  30.29 
 
 
710 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39940  hypothetical protein  36.72 
 
 
382 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>