97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3747 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  715    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  47.43 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  53.67 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  43.65 
 
 		 377 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  47.32 
 
 		 377 aa  293  4e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  45.38 
 
 		 359 aa  252  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  40.32 
 
 		 318 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  36.08 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  33.23 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  34.84 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  31.17 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  33.85 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  34.16 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  31.4 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  32.62 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  31.14 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  33.64 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  35.11 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  33.33 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  32.54 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  33.13 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  33.33 
 
 		 343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  35.24 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  33.64 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  31.76 
 
 		 380 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  35.03 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  35.24 
 
 		 377 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  35.24 
 
 		 376 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  34.62 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  29.43 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  29.88 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  28.19 
 
 		 330 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  30.72 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  31.05 
 
 		 324 aa  99.8  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  28.34 
 
 		 320 aa  99.4  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  31.07 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  30.21 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  25 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  27.88 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  29.13 
 
 		 330 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  29.13 
 
 		 333 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  24.58 
 
 		 384 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  32.81 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  29.54 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  27.36 
 
 		 392 aa  85.9  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  28.87 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  26.11 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  28.87 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  26.34 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  26.49 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  27.36 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  26.19 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  26.19 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  27.98 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  27.98 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  27.98 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  26.75 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  26.98 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  26.92 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  26.92 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  26.92 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  26.19 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  27 
 
 		 346 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  26.98 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  20.24 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  27.78 
 
 		 336 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39940  hypothetical protein  28.62 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111954  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  27.09 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  25.48 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  26.92 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  27.92 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1006 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  39.71 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  25.77 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  25.4 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  24.85 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  27.81 
 
 		 364 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  25.15 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  22.58 
 
 		 770 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  25.15 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  25.15 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  29.67 
 
 		 817 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  39.39 
 
 		 349 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3521  hypothetical protein  25.34 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02470  hypothetical protein  29.26 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  21.68 
 
 		 771 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  21.02 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  24.26 
 
 		 730 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  20.72 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  20.72 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  25.53 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  22.41 
 
 		 679 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1890  secretion protein HlyD family protein  30.41 
 
 		 368 aa  43.1  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>