111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0949 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  684    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  53.35 
 
 		 349 aa  285  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  45.35 
 
 		 367 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  39.82 
 
 		 349 aa  198  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  41.81 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  36.59 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  40.2 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  37.3 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  38.59 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  37.96 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  39.63 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  37.06 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  35.52 
 
 		 361 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  36.06 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  37.06 
 
 		 324 aa  156  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  38.67 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  36.62 
 
 		 333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  33.64 
 
 		 380 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  37.5 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  36.2 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  35.87 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  34.04 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  34.04 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  34.04 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  38.58 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  36.42 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  37.5 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  36.58 
 
 		 330 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  36.58 
 
 		 330 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  36.58 
 
 		 330 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  38.48 
 
 		 318 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  35.08 
 
 		 329 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  35.08 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  37.99 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  33.85 
 
 		 376 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  33.85 
 
 		 377 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  30.93 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  32.42 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  31.91 
 
 		 335 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  36.59 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  33.97 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  34.67 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  32.79 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  33.9 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  32.34 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  32.34 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  32.14 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  32.34 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  32.14 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  35.53 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  35.53 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  35.53 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  32.14 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  33.54 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  31.56 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  31.56 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  31.56 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  31.61 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  28.22 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  29.48 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  31.02 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  29.18 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  29.18 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  30.28 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  31.33 
 
 		 344 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  25.53 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  30.77 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  32.52 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  25.08 
 
 		 344 aa  96.3  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  31.33 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  26.58 
 
 		 392 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  28.1 
 
 		 369 aa  92.8  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  31.21 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  31.21 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  31.21 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  22.96 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  23.96 
 
 		 330 aa  86.7  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  27.46 
 
 		 368 aa  86.3  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  31.48 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  31.48 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  23.71 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  23.1 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  27.6 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2618  hypothetical protein  30.86 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  29.17 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  26.81 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  26.91 
 
 		 679 aa  72.8  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39940  hypothetical protein  28.11 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  24.23 
 
 		 771 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  24.93 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  38.21 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1006 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  30.04 
 
 		 817 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  30.54 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  29.07 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  29.28 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  25.77 
 
 		 762 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  41.18 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  26.24 
 
 		 359 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  32.37 
 
 		 989 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>