105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2414 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  100 
 
 
325 aa  626  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  60.74 
 
 
328 aa  321  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  49.39 
 
 
329 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  47.06 
 
 
330 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  44.72 
 
 
330 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  44.72 
 
 
330 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  44.92 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  46.3 
 
 
332 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  47.19 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  47.19 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  47.19 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  46.79 
 
 
318 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  46.79 
 
 
318 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  46.79 
 
 
318 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  39.46 
 
 
332 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  41.41 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  41.41 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  41.41 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  42.02 
 
 
380 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  39.06 
 
 
331 aa  172  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  38.78 
 
 
342 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  41.03 
 
 
382 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  35.84 
 
 
327 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  40.53 
 
 
331 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  39.12 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  39.12 
 
 
279 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  41.04 
 
 
335 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  41.04 
 
 
335 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  37.7 
 
 
327 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  40.72 
 
 
335 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  39.81 
 
 
361 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  38.7 
 
 
273 aa  159  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  38.05 
 
 
349 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  38.67 
 
 
346 aa  155  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  37.5 
 
 
344 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  38.56 
 
 
326 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  38.56 
 
 
326 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  38.56 
 
 
326 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2618  hypothetical protein  37.3 
 
 
297 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  36.99 
 
 
336 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  35.26 
 
 
332 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  36.11 
 
 
331 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  32.49 
 
 
367 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  34.42 
 
 
343 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  34.95 
 
 
343 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  36.76 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  34.97 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  36.34 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  36.34 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  36.34 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  36.34 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  34.97 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  36.34 
 
 
343 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  33.67 
 
 
320 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  37.69 
 
 
349 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  36.34 
 
 
343 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  34.56 
 
 
335 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  35.69 
 
 
324 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  36.04 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  35.59 
 
 
318 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  34.65 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  36.1 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  33.23 
 
 
342 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  35.08 
 
 
324 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  34.06 
 
 
380 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  29.52 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  32.72 
 
 
335 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  34.24 
 
 
343 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  34.25 
 
 
335 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  37.31 
 
 
375 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  36.7 
 
 
376 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  36.7 
 
 
377 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  36.98 
 
 
315 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  31.07 
 
 
359 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  32.25 
 
 
326 aa  96.7  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  34.59 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  29.53 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  27.38 
 
 
377 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  26.3 
 
 
339 aa  90.9  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  25.66 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  27.08 
 
 
377 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  44.83 
 
 
271 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  24.69 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  30.46 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  26.73 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  24.31 
 
 
771 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  27.96 
 
 
1006 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  29.19 
 
 
968 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  27.13 
 
 
355 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  33.82 
 
 
378 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  28.47 
 
 
390 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  27 
 
 
359 aa  56.2  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  22.29 
 
 
372 aa  55.8  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  29.8 
 
 
989 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  21.88 
 
 
770 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  24.64 
 
 
679 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  24.68 
 
 
375 aa  49.7  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2004  hypothetical protein  29.6 
 
 
243 aa  50.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.250588  hitchhiker  0.00405078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  27.99 
 
 
402 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.87 
 
 
684 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>