90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2157 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  763    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  60.6 
 
 
384 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  29.41 
 
 
372 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  26.74 
 
 
377 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  26.69 
 
 
344 aa  107  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  29.46 
 
 
335 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  28.95 
 
 
392 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  29.79 
 
 
343 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  29.36 
 
 
318 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  27.23 
 
 
377 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  26.4 
 
 
330 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  30.06 
 
 
335 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  28.53 
 
 
343 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  27.9 
 
 
343 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  26.84 
 
 
369 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  27.9 
 
 
343 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  27.9 
 
 
343 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  28.97 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  27.59 
 
 
343 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  27.59 
 
 
343 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  27.59 
 
 
343 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  30.29 
 
 
343 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  26.23 
 
 
368 aa  93.6  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  29 
 
 
343 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  26.58 
 
 
339 aa  90.1  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  28.26 
 
 
349 aa  89.7  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  29.73 
 
 
343 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  25.51 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  24.61 
 
 
335 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  26.3 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  26.73 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  24.14 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  26.99 
 
 
332 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  26.4 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  26.4 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  28.57 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  23.9 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  30.19 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  26.5 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  24.71 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  26.9 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  23.75 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  25.87 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1140  hypothetical protein  29.44 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0783144  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  27.24 
 
 
346 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  25.68 
 
 
351 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02470  hypothetical protein  28.03 
 
 
325 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  25.29 
 
 
349 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  26.77 
 
 
331 aa  59.7  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  25.15 
 
 
328 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  26.05 
 
 
315 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  24.84 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  25 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  27.04 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  24.23 
 
 
364 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  24.7 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  23.68 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  24.68 
 
 
324 aa  53.9  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39940  hypothetical protein  25.91 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111954  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  25.22 
 
 
330 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  23.28 
 
 
730 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  25.22 
 
 
330 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  25.22 
 
 
330 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  25.49 
 
 
770 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  25.47 
 
 
330 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  30.67 
 
 
336 aa  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  22.61 
 
 
335 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  22.61 
 
 
335 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  25.25 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  35.05 
 
 
325 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  22.61 
 
 
335 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  23.66 
 
 
331 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  20.96 
 
 
679 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  23.3 
 
 
342 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  34.67 
 
 
367 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  24.92 
 
 
326 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  24.92 
 
 
326 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  24.92 
 
 
326 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  25.44 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  31.11 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  31.11 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  24.58 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  24.58 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  24.58 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  22.61 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  31.11 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  23.05 
 
 
817 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  27.21 
 
 
227 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  23.34 
 
 
271 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  21.88 
 
 
342 aa  43.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>