85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3174 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  694    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  47.55 
 
 
369 aa  309  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  45.5 
 
 
377 aa  306  3e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  44.69 
 
 
377 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  51.49 
 
 
368 aa  291  9e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  49.52 
 
 
359 aa  248  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  36.71 
 
 
318 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  30.89 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  32.08 
 
 
344 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  34.9 
 
 
361 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  34.9 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  34.31 
 
 
343 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  34.31 
 
 
343 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  34.31 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  34.31 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  34.31 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  34.31 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  28.23 
 
 
339 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  33.04 
 
 
343 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  33.33 
 
 
343 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  32.08 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  33.53 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  31.71 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  33.54 
 
 
376 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  33.54 
 
 
377 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  32.61 
 
 
375 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  32.25 
 
 
343 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  33.12 
 
 
320 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  33.54 
 
 
315 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  29.01 
 
 
333 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  31.4 
 
 
380 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  27.25 
 
 
392 aa  89.4  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  28.7 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  26.79 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  31.29 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  31.45 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  29.91 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  28.7 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  30.72 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  31.53 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  28.83 
 
 
323 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  24.84 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  28.97 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  23.75 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  30.32 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  28.75 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  28.44 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  31.58 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  19.28 
 
 
372 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  30.4 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  29.29 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  28.07 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  28.88 
 
 
1006 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  29.95 
 
 
679 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  31.29 
 
 
817 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  27.13 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  32.11 
 
 
367 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  27.4 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  26.21 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  27.79 
 
 
329 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  26.47 
 
 
730 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  28.71 
 
 
336 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  28.25 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  28.25 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  28.25 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  25.95 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  26.52 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  28.62 
 
 
327 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  26.57 
 
 
672 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  25.82 
 
 
325 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  26.22 
 
 
330 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  26.22 
 
 
330 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  24.74 
 
 
684 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3521  hypothetical protein  26.64 
 
 
353 aa  49.7  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1968  hypothetical protein  29.67 
 
 
726 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  25.48 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  26.07 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  27.66 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  26.07 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  26.07 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  24.44 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  25.58 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  38.36 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02470  hypothetical protein  29.03 
 
 
325 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39940  hypothetical protein  28.62 
 
 
382 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>