112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0990 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  664    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  37.54 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  38.31 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  38.22 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  37.81 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  37.81 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  38.78 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  34.15 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  39.37 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  38.31 
 
 		 382 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  38.33 
 
 		 380 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  37.38 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  36.49 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  36.49 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  36.49 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  39.24 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  39.24 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  39.24 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  35.71 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  38.99 
 
 		 361 aa  142  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  37.03 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  37.46 
 
 		 343 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  34.47 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  32.93 
 
 		 330 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  32.83 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  31.74 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  31.74 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  36.88 
 
 		 343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  32.73 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  31.74 
 
 		 335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  33.75 
 
 		 332 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  36.53 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  32.37 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  35.62 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  36.02 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  36.02 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  36.02 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  35.71 
 
 		 343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  35.71 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  36.34 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  37.54 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  35.71 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  35.42 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  35.96 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  29.67 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  35.91 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  32.13 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  34.88 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  32.33 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  32.54 
 
 		 332 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  36.67 
 
 		 336 aa  112  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  38.91 
 
 		 315 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  27.78 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  33.96 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  33.96 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  33.96 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  31.61 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  32.82 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  32.26 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  28.88 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  34.29 
 
 		 318 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  30.63 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  30.28 
 
 		 279 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  31.87 
 
 		 380 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  27.22 
 
 		 377 aa  93.2  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  29.51 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  27.89 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  28.17 
 
 		 369 aa  89.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  26.58 
 
 		 377 aa  89.4  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  43.41 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  28.22 
 
 		 326 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  23.42 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  31.19 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  29.08 
 
 		 392 aa  86.3  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  22.46 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2618  hypothetical protein  44.14 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  47.47 
 
 		 271 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  23.74 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  32.81 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  28.99 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  27.74 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  32.49 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  32.49 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  24.43 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1006 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  27.9 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  27.9 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  27.9 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  25.17 
 
 		 679 aa  72.8  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  34.07 
 
 		 989 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  24.54 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  28.75 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  34.71 
 
 		 968 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  27.66 
 
 		 402 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1968  hypothetical protein  29.59 
 
 		 726 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  27.67 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  41.03 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  21.13 
 
 		 770 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39940  hypothetical protein  28.08 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  25.51 
 
 		 762 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>