83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1381 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  100 
 
 		 355 aa  701    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  34 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  31.58 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  32.76 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  31.02 
 
 		 323 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  31.44 
 
 		 335 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  33.88 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  28.57 
 
 		 361 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  32.04 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  32.47 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  32.43 
 
 		 349 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  29.09 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  28.32 
 
 		 343 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  31.34 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  31.71 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  29.24 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  29.34 
 
 		 331 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  31.71 
 
 		 333 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  31.81 
 
 		 331 aa  86.3  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  30.7 
 
 		 342 aa  86.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  30.35 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  29.51 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  31.69 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  30.79 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  30.2 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  29.28 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  30.66 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  28.82 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  29.28 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  29.43 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  29.57 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  32.36 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  31.52 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  31.52 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  31.23 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  27.5 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  31.52 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  29.23 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  30.43 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  30.43 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  29.23 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  29.23 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  29.36 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  29.36 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  29.23 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  29.36 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  29.23 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  29.23 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  30.03 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  30 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  23.86 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  28.45 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  25.07 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  25.28 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  30.55 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  30.55 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  28.13 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  30.55 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  26.41 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  29.75 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  29.75 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  29.34 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  26.51 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  29.75 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  28.25 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  29.63 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  27.92 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  24.86 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  28.57 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  28.85 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  28.87 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  43.66 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  25 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  25.49 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  31.5 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  27.67 
 
 		 326 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  27.67 
 
 		 326 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  27.67 
 
 		 326 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  46.15 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  27.67 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  23.12 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  22.46 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  28.16 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>