98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2245 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  777    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  93.1 
 
 		 377 aa  728    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  55.71 
 
 		 369 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  58.58 
 
 		 368 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  45.38 
 
 		 359 aa  302  8.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  47.32 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  43.17 
 
 		 318 aa  263  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  36.1 
 
 		 330 aa  212  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  36.51 
 
 		 344 aa  192  7e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  32.72 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  29.61 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  31.89 
 
 		 335 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  31.27 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  32.1 
 
 		 335 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  30.43 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  31.27 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  30.34 
 
 		 343 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  30.65 
 
 		 343 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  30.34 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  30.03 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  30.03 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  30.03 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  30.03 
 
 		 343 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  31.78 
 
 		 380 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  29.6 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  28.79 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  31.71 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  31.71 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  25.5 
 
 		 392 aa  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  29.43 
 
 		 349 aa  109  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  31.37 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  27.23 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  27.91 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  26.92 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  26.93 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  28.18 
 
 		 324 aa  93.2  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  25.62 
 
 		 333 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  25.31 
 
 		 330 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  28.84 
 
 		 315 aa  90.1  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  23.03 
 
 		 330 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  26.58 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  27.1 
 
 		 331 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  26.44 
 
 		 324 aa  87.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  25.87 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  26.2 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  27.38 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  23.58 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  26.77 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  23.17 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  27.08 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  25.54 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  27.8 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1006 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  23.08 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  24.43 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  22.77 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  22.77 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  25.6 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  24.53 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  25.16 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  24.69 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  23.1 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  22.77 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  22.77 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  22.77 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  27.16 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  24.45 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  22.74 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  24.78 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  22.41 
 
 		 771 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  28.27 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  22.39 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  22.39 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  22.39 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  24.92 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  25.4 
 
 		 679 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  25.54 
 
 		 817 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  24.36 
 
 		 336 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  23.89 
 
 		 770 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  22.42 
 
 		 331 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  21.59 
 
 		 342 aa  53.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  24.42 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  21.71 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  21.71 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  22.04 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  23.17 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  22.01 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39940  hypothetical protein  23.21 
 
 		 382 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  21.9 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  20.42 
 
 		 730 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02470  hypothetical protein  28.42 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  22.87 
 
 		 325 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  22.87 
 
 		 325 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  22.87 
 
 		 325 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  30 
 
 		 271 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  29.5 
 
 		 672 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  21.25 
 
 		 279 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  21.25 
 
 		 297 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>