60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02470 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_02470  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  621  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  28.93 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  29.39 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  30.89 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1140  hypothetical protein  31.83 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0783144  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  25.08 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  28.34 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  31.82 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  30.69 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  32.79 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  30.3 
 
 
361 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  34.27 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  29.32 
 
 
335 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  39.45 
 
 
315 aa  56.6  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  30.6 
 
 
335 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  35.2 
 
 
343 aa  56.2  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  32.26 
 
 
343 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  30.65 
 
 
336 aa  55.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  29.83 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  36.62 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  40.62 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  26.53 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  32.26 
 
 
343 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  19.55 
 
 
372 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  32.26 
 
 
343 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  32.26 
 
 
343 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  32.26 
 
 
343 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  32.26 
 
 
343 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  30.6 
 
 
343 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  28.9 
 
 
343 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  27.41 
 
 
369 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  29.7 
 
 
336 aa  53.1  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  28.42 
 
 
377 aa  53.1  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  31.93 
 
 
343 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  27.87 
 
 
377 aa  52.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  35.14 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  31.72 
 
 
343 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  44.26 
 
 
380 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  36.36 
 
 
342 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  47.69 
 
 
328 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3521  hypothetical protein  26.51 
 
 
353 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  31.16 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  28.72 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  25.58 
 
 
684 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  40.62 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  21.63 
 
 
770 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  27.96 
 
 
359 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  36.36 
 
 
375 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  36.36 
 
 
376 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  42.42 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  29.57 
 
 
382 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  36.36 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  42.5 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  35.24 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  40.91 
 
 
329 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  23.86 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  46.97 
 
 
325 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  46.97 
 
 
325 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  46.97 
 
 
325 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  21.24 
 
 
771 aa  43.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>