102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2045 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  720    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  33.74 
 
 		 679 aa  179  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 817 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  29.58 
 
 		 770 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1006 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  28.7 
 
 		 968 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1749  hypothetical protein  31.45 
 
 		 709 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1796  hypothetical protein  31.45 
 
 		 709 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284537  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1730  hypothetical protein  31.45 
 
 		 709 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  23.25 
 
 		 762 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  24.25 
 
 		 989 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  26.12 
 
 		 730 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  30.68 
 
 		 710 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  25.84 
 
 		 771 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  25.55 
 
 		 684 aa  95.5  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  25.5 
 
 		 672 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1968  hypothetical protein  25.66 
 
 		 726 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  27.51 
 
 		 390 aa  89.7  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  28.25 
 
 		 335 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  27.14 
 
 		 335 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  27.97 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11385  hypothetical protein  26.44 
 
 		 715 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1624  molybdopterin biosynthesis protein MoeY  26.46 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00849574  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  31.41 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  28.88 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  24.6 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12361  hypothetical protein  25.92 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  28.06 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  24.28 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  28.93 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  26.71 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  26.71 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  26.91 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  26.35 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  26.35 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  26.35 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  26.71 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  28.16 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  28.37 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  24.08 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  24.01 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  26.98 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  23.8 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  27.37 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  24.19 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  28 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  28.27 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  25.68 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  27.92 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  24.47 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  27.66 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  27.02 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  27 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  26.5 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  30.32 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  27.66 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  28.32 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  30.17 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  26.47 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  24.93 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  27.19 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  25.82 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  22.9 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0204  hypothetical protein  30.04 
 
 		 711 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  29.96 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  25.36 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  29.96 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  28.99 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  24.56 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  28.99 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  24.56 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  28.99 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  30.7 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  28.73 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  30.7 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  28.73 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  30.7 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  24.56 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  28.73 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  24.04 
 
 		 344 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  22.54 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  22.84 
 
 		 384 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  27.59 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  27.92 
 
 		 359 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  24.03 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  28.28 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  24.83 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  26.4 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  26.4 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  30.23 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  26.4 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  28.57 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2618  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  23.63 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  23.57 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  27.03 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  25.82 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39940  hypothetical protein  29.93 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  28.87 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143021 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>