210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2389 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  41.37 
 
 		 770 aa  653    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  100 
 
 		 762 aa  1565    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  38.93 
 
 		 771 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  39.36 
 
 		 817 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  36.7 
 
 		 730 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.57 
 
 		 371 aa  364  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11385  hypothetical protein  34.57 
 
 		 715 aa  357  5.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1749  hypothetical protein  32.93 
 
 		 709 aa  348  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1796  hypothetical protein  32.93 
 
 		 709 aa  348  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284537  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1730  hypothetical protein  32.93 
 
 		 709 aa  348  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1968  hypothetical protein  35.04 
 
 		 726 aa  342  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0204  hypothetical protein  34.17 
 
 		 711 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  33.48 
 
 		 710 aa  325  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0566  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.99 
 
 		 674 aa  304  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297383  normal  0.30294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1081  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.48 
 
 		 370 aa  171  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  26.13 
 
 		 679 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.8 
 
 		 387 aa  139  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  24.48 
 
 		 989 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  25.07 
 
 		 968 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  24.08 
 
 		 672 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  23.25 
 
 		 351 aa  107  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1006 aa  103  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  23.3 
 
 		 684 aa  92.4  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  26.96 
 
 		 339 aa  72  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.91 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  27.15 
 
 		 320 aa  66.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  25.58 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  26.39 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0191  hypothetical protein  41.18 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.409062  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2502  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.04 
 
 		 292 aa  63.9  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0151  hypothetical protein  29.27 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.26 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  33.55 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.27 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  25.5 
 
 		 402 aa  60.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.1 
 
 		 254 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  24.1 
 
 		 335 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1157  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.51 
 
 		 215 aa  59.7  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.46 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  19.93 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  28.64 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1525  hypothetical protein  35.82 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.46 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1623  hypothetical protein  31.21 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  25.44 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0946  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.76 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  25.51 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  25.09 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  23.14 
 
 		 344 aa  57.4  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  21.88 
 
 		 392 aa  57  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1624  molybdopterin biosynthesis protein MoeY  22.76 
 
 		 369 aa  57  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00849574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.8 
 
 		 256 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  25.82 
 
 		 361 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  31.61 
 
 		 252 aa  55.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.22 
 
 		 255 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.43 
 
 		 403 aa  55.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.75 
 
 		 255 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  23.05 
 
 		 343 aa  55.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.39 
 
 		 267 aa  54.7  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.049758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.39 
 
 		 267 aa  54.7  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0318516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  28.48 
 
 		 367 aa  54.7  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.67 
 
 		 252 aa  54.7  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.21 
 
 		 255 aa  54.7  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2396  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  54.3  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000837429  normal  0.548926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.27 
 
 		 244 aa  54.3  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  26.58 
 
 		 255 aa  54.3  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  31.85 
 
 		 331 aa  54.3  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  27.14 
 
 		 331 aa  54.3  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  22.74 
 
 		 343 aa  53.9  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.12 
 
 		 255 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  22.74 
 
 		 343 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.33 
 
 		 207 aa  53.1  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  22.41 
 
 		 343 aa  53.5  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  27.63 
 
 		 327 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1178  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.09 
 
 		 267 aa  52.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  22.15 
 
 		 343 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  22.15 
 
 		 343 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  22.15 
 
 		 343 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  24.56 
 
 		 364 aa  53.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  26.94 
 
 		 257 aa  52.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12362  hypothetical protein  27.47 
 
 		 318 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.58 
 
 		 274 aa  52.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.47 
 
 		 285 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  30.77 
 
 		 285 aa  52  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  26.18 
 
 		 335 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1149  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.77 
 
 		 265 aa  52  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000110097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  26.18 
 
 		 335 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  25.39 
 
 		 344 aa  52  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  26.18 
 
 		 335 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1276  thiamine biosynthesis protein ThiF  32 
 
 		 283 aa  51.2  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0911002  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.84 
 
 		 242 aa  51.2  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5899  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.47 
 
 		 285 aa  51.2  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  26.83 
 
 		 323 aa  50.8  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12361  hypothetical protein  23.1 
 
 		 372 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.77 
 
 		 285 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  34.46 
 
 		 300 aa  50.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1816  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.61 
 
 		 364 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1956  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.77 
 
 		 285 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3958  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4378  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.19 
 
 		 261 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2567  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.77 
 
 		 285 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>