157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0566 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0566  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
674 aa  1338    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297383  normal  0.30294 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  49.35 
 
 
817 aa  337  5e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  43.99 
 
 
762 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  43.7 
 
 
771 aa  303  8.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.7 
 
 
371 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  40.2 
 
 
770 aa  300  4e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1749  hypothetical protein  50 
 
 
709 aa  260  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1796  hypothetical protein  50 
 
 
709 aa  260  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284537  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1730  hypothetical protein  50 
 
 
709 aa  260  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11385  hypothetical protein  44.01 
 
 
715 aa  251  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  43.08 
 
 
730 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0204  hypothetical protein  48.74 
 
 
711 aa  240  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1968  hypothetical protein  48.9 
 
 
726 aa  234  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  46.57 
 
 
710 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1081  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.49 
 
 
370 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.36 
 
 
387 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  36.18 
 
 
989 aa  80.9  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.57 
 
 
684 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  32.48 
 
 
968 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2502  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.97 
 
 
292 aa  66.6  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  31.54 
 
 
679 aa  64.7  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  32.88 
 
 
672 aa  62.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.01 
 
 
403 aa  62.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.71 
 
 
267 aa  62  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0151  hypothetical protein  35 
 
 
300 aa  61.2  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.82 
 
 
267 aa  60.8  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.1 
 
 
393 aa  60.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1623  hypothetical protein  37.16 
 
 
295 aa  60.1  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240534  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.93 
 
 
267 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.79 
 
 
393 aa  58.9  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  34.01 
 
 
393 aa  58.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1157  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.9 
 
 
215 aa  58.2  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.62 
 
 
398 aa  58.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.08 
 
 
386 aa  57.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  33.8 
 
 
1006 aa  57.4  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.41 
 
 
392 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.97 
 
 
392 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.91 
 
 
219 aa  55.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00160483  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2046  hypothetical protein  34.09 
 
 
290 aa  55.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000420492  hitchhiker  0.0000188727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1525  hypothetical protein  34.51 
 
 
287 aa  55.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.25 
 
 
242 aa  55.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.62 
 
 
270 aa  53.5  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.03 
 
 
242 aa  53.9  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.97 
 
 
393 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3072  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.04 
 
 
267 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1659  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.23 
 
 
200 aa  52.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1588  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.14 
 
 
259 aa  52.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.475165  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.19 
 
 
239 aa  53.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.93 
 
 
268 aa  52.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.3 
 
 
253 aa  52  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1572  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.58 
 
 
199 aa  52.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109403  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1867  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
237 aa  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.34 
 
 
386 aa  52.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.08 
 
 
390 aa  51.6  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.03 
 
 
390 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  26.64 
 
 
255 aa  52  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1855  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.63 
 
 
199 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1158  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.97 
 
 
201 aa  52  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00601178  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0191  hypothetical protein  35.86 
 
 
291 aa  51.6  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.409062  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.54 
 
 
383 aa  51.2  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1276  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.07 
 
 
283 aa  51.2  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0911002  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  32.21 
 
 
267 aa  50.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2513  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.2 
 
 
219 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000693793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.97 
 
 
254 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.54 
 
 
252 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9116  molybdopterin biosynthesis protein  37.23 
 
 
293 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.54 
 
 
251 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3522  molybdopterin and thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing enzyme  37.84 
 
 
298 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30 
 
 
383 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.54 
 
 
254 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  30.15 
 
 
275 aa  49.3  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.15 
 
 
275 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  30.07 
 
 
252 aa  48.9  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.03 
 
 
396 aa  48.5  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3717  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.14 
 
 
249 aa  48.5  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.09 
 
 
274 aa  48.1  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.91 
 
 
254 aa  48.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251146  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.92 
 
 
295 aa  48.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  26.45 
 
 
386 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5267  molybdopterin and thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing enzyme  36.62 
 
 
298 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2396  hypothetical protein  31.03 
 
 
290 aa  47.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000837429  normal  0.548926 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.89 
 
 
207 aa  48.1  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.91 
 
 
253 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  34.62 
 
 
389 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.23 
 
 
383 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3926  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.25 
 
 
364 aa  48.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0371  thiamine biosynthesis protein ThiF  26.17 
 
 
203 aa  47.8  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  29.41 
 
 
275 aa  47.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.3 
 
 
268 aa  47.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000533838  hitchhiker  0.000000527658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0252  molybdopterin and thiamine biosynthesis protein  29.73 
 
 
272 aa  47.4  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1682  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.23 
 
 
207 aa  47.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000522342  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  28.89 
 
 
268 aa  47.4  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2082  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.67 
 
 
288 aa  47.4  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.44 
 
 
255 aa  47.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4878  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.73 
 
 
249 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  28.78 
 
 
268 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.29 
 
 
300 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  28.78 
 
 
268 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  28.78 
 
 
268 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  28.78 
 
 
268 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>