More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0191 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0191  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  590  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.409062  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2502  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  62.77 
 
 
292 aa  342  4e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  57.24 
 
 
684 aa  335  5e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1623  hypothetical protein  56.64 
 
 
295 aa  330  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240534  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0151  hypothetical protein  57.84 
 
 
300 aa  325  8.000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  57.41 
 
 
672 aa  315  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2396  hypothetical protein  57.35 
 
 
290 aa  301  8.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000837429  normal  0.548926 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1525  hypothetical protein  54.8 
 
 
287 aa  295  6e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  48.53 
 
 
989 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  43.82 
 
 
679 aa  226  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12362  hypothetical protein  44.72 
 
 
318 aa  222  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  47.62 
 
 
1006 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  46.69 
 
 
968 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2046  hypothetical protein  41.79 
 
 
290 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000420492  hitchhiker  0.0000188727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38 
 
 
258 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.33 
 
 
258 aa  89.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157166 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1588  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.75 
 
 
259 aa  89.4  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.475165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  37.33 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.67 
 
 
258 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2082  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.77 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.36 
 
 
242 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  36.43 
 
 
273 aa  85.9  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  36.67 
 
 
255 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  32.21 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  31.54 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.01 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  35.62 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.48 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  33.12 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.92 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  39.17 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  33.12 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3812  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.58 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.54 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  32.18 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1283  thiamine biosynthesis protein ThiF family protein  31.28 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3218  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.36 
 
 
281 aa  77  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1936  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.52 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1265  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.33 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  36.43 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01710  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  33.54 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
383 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.04 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1922  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.08 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459243  normal  0.0162799 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2504  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.71 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00024143  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.69 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2278  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.67 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00531511  hitchhiker  0.000000738809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  41.18 
 
 
762 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3522  molybdopterin and thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing enzyme  30 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0994  hypothetical protein  32 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186232  normal  0.0867734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2423  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.3 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.42 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  32.05 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1706  ThiF protein, putative  27.9 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.32 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5267  molybdopterin and thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing enzyme  30.67 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.1 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251146  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2539  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.77 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.214496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  31.54 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.21 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  36.13 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2171  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.82 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  36.97 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.97 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  36.97 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1847  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1043  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  33.33 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044291  hitchhiker  0.000000000393673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  36.97 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  36.97 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.97 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  36.97 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  36.97 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.89 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11385  hypothetical protein  30.28 
 
 
715 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.99 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  33.06 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07990  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  31.61 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000402237  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.28 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.049758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.28 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0318516 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.61 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1659  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.97 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0187  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.09 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.635564 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.06 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.333296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.43 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.97 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17601  molybdopterin biosynthesis protein  29.61 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.61 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.59 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  31.52 
 
 
423 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.67 
 
 
383 aa  72.8  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.11 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4744  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.43 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  35.29 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.7 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.266567  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  35.29 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1816  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.76 
 
 
364 aa  72.4  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  35.29 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>