220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2794 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  41.37 
 
 		 762 aa  653    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  100 
 
 		 770 aa  1580    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  44.11 
 
 		 771 aa  625  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  38.1 
 
 		 817 aa  522  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.89 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  32.6 
 
 		 730 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1968  hypothetical protein  31.38 
 
 		 726 aa  350  7e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  35.16 
 
 		 710 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11385  hypothetical protein  32.45 
 
 		 715 aa  342  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1749  hypothetical protein  30.91 
 
 		 709 aa  342  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1796  hypothetical protein  30.91 
 
 		 709 aa  342  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284537  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1730  hypothetical protein  30.91 
 
 		 709 aa  342  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0566  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.09 
 
 		 674 aa  299  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297383  normal  0.30294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0204  hypothetical protein  31.2 
 
 		 711 aa  294  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1081  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.14 
 
 		 370 aa  152  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  29.58 
 
 		 351 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  26.35 
 
 		 679 aa  130  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.99 
 
 		 387 aa  121  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  22.77 
 
 		 672 aa  95.5  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1006 aa  88.2  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  25.61 
 
 		 336 aa  72  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  21.31 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  24.41 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.83 
 
 		 684 aa  70.1  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  24.41 
 
 		 330 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  27.55 
 
 		 320 aa  69.3  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  24.22 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1157  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.08 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  23.88 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  24.72 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0151  hypothetical protein  35.37 
 
 		 300 aa  66.6  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1525  hypothetical protein  33.73 
 
 		 287 aa  67  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  23.88 
 
 		 343 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  24.61 
 
 		 361 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  23.88 
 
 		 343 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  23.88 
 
 		 343 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  23.88 
 
 		 343 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  23.88 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  25.27 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1624  molybdopterin biosynthesis protein MoeY  21.62 
 
 		 369 aa  63.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00849574  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2502  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.67 
 
 		 292 aa  63.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.59 
 
 		 267 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  25.89 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  23.37 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  36.44 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  21.86 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  28.77 
 
 		 989 aa  61.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  25.61 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1178  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.11 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.59 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  23.58 
 
 		 368 aa  60.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  23.44 
 
 		 968 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  22.19 
 
 		 326 aa  60.1  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  22.44 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  21.13 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  23.34 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.75 
 
 		 398 aa  57.4  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  27.03 
 
 		 267 aa  57  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.049758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  27.03 
 
 		 267 aa  57  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0318516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.14 
 
 		 256 aa  57.4  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  22.71 
 
 		 330 aa  56.6  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  22.3 
 
 		 318 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  31.69 
 
 		 275 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1149  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.45 
 
 		 265 aa  56.2  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000110097  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  25 
 
 		 330 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12361  hypothetical protein  22.65 
 
 		 372 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  25 
 
 		 330 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.17 
 
 		 242 aa  56.6  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  25 
 
 		 330 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  24.07 
 
 		 349 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1276  thiamine biosynthesis protein ThiF  36.67 
 
 		 283 aa  55.5  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0911002  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  27.32 
 
 		 344 aa  55.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  33.7 
 
 		 344 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  23.89 
 
 		 377 aa  55.1  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  23.35 
 
 		 377 aa  55.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.69 
 
 		 275 aa  55.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  24.01 
 
 		 335 aa  54.7  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.61 
 
 		 242 aa  54.7  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  31.69 
 
 		 275 aa  54.7  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1659  thiamine biosynthesis protein ThiF  28.99 
 
 		 200 aa  54.3  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3218  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.78 
 
 		 281 aa  53.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  26.38 
 
 		 343 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  24.19 
 
 		 380 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.37 
 
 		 392 aa  53.5  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  22.81 
 
 		 349 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1572  thiamine biosynthesis protein ThiF  28.47 
 
 		 199 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109403  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1623  hypothetical protein  34.17 
 
 		 295 aa  53.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2122  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.66 
 
 		 247 aa  53.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0389221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3072  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.41 
 
 		 267 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.38 
 
 		 392 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3251  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.36 
 
 		 270 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  0.608278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  27.13 
 
 		 329 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.05 
 
 		 403 aa  52.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  23.02 
 
 		 332 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.15 
 
 		 274 aa  52  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  22.3 
 
 		 343 aa  52.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1158  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.61 
 
 		 201 aa  52.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00601178  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  24.77 
 
 		 332 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  27.91 
 
 		 330 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  27.91 
 
 		 330 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>