More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4878 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4878  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
249 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3180  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  58.02 
 
 
249 aa  258  4e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.507931  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.82 
 
 
263 aa  251  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1602  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.82 
 
 
277 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4744  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.15 
 
 
263 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.01 
 
 
267 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.90233  hitchhiker  0.0000000000838501 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3157  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.62 
 
 
261 aa  245  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.82 
 
 
275 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1632  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.82 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  0.0862863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0089  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.23 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0215  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  51.01 
 
 
266 aa  241  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0617  molybdenum cofactor biosynthesis protein  50.61 
 
 
265 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0046  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  51.42 
 
 
266 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.6 
 
 
272 aa  240  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0038  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  51.01 
 
 
278 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal  0.260889 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2171  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.19 
 
 
255 aa  238  8e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0364  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  51.01 
 
 
266 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3634  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.41 
 
 
262 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0074  putative molybdopterin biosynthesis protein moeB  51.01 
 
 
267 aa  234  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_004310  BR0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  52.28 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4128  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.8 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal  0.228572 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.87 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00436321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3793  molybdopterin biosynthesis protein  53.2 
 
 
271 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50 
 
 
253 aa  229  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.714167  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.2 
 
 
264 aa  228  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0006  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.96 
 
 
260 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762533  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49 
 
 
278 aa  226  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.21 
 
 
280 aa  224  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.98 
 
 
266 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.19 
 
 
393 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.44 
 
 
399 aa  222  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1380  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.38 
 
 
271 aa  221  7e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0002  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  50 
 
 
264 aa  221  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2774  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.03 
 
 
399 aa  221  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165705  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.57 
 
 
388 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1231  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  45.99 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.99 
 
 
392 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  48.21 
 
 
269 aa  219  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1265  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.4 
 
 
287 aa  219  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3396  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  52.07 
 
 
258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270344  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2002  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.21 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  47.79 
 
 
393 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.62 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48 
 
 
395 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.78 
 
 
392 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.96 
 
 
253 aa  214  9e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4411  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.21 
 
 
274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.19 
 
 
390 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  45.75 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.59 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  46.96 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  46.59 
 
 
393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.13 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0034  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.56 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439342  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1141  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.34 
 
 
266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.158288  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  46.37 
 
 
264 aa  211  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4091  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.45 
 
 
274 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  48.19 
 
 
390 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.94 
 
 
254 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  47.04 
 
 
396 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  43.21 
 
 
257 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.2 
 
 
270 aa  209  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  43.32 
 
 
253 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.59 
 
 
379 aa  209  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.59 
 
 
379 aa  209  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.8 
 
 
392 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  44.98 
 
 
393 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.76 
 
 
389 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.8 
 
 
403 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  47.15 
 
 
386 aa  209  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.39 
 
 
390 aa  208  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.53 
 
 
254 aa  208  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.58 
 
 
383 aa  208  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.32 
 
 
250 aa  208  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.16 
 
 
248 aa  208  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5055  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.85 
 
 
250 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.81 
 
 
386 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.98 
 
 
379 aa  206  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.91 
 
 
247 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.78 
 
 
383 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1980  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44 
 
 
270 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019523  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2974  molydopterin biosynthesis protein  44.62 
 
 
346 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.94 
 
 
254 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  45.16 
 
 
390 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2855  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  43.2 
 
 
248 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000693391  hitchhiker  0.000000536113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.94 
 
 
252 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.58 
 
 
364 aa  205  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2240  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44 
 
 
270 aa  205  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.36 
 
 
480 aa  205  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.24 
 
 
273 aa  205  6e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.8 
 
 
383 aa  205  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.16 
 
 
393 aa  204  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  45.16 
 
 
390 aa  204  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  44.76 
 
 
393 aa  204  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.11 
 
 
252 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0462  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.77 
 
 
358 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.987597  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1083  putative molybdopterin biosynthesis protein  46.15 
 
 
254 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365488  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  47.98 
 
 
398 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.72 
 
 
259 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.94 
 
 
348 aa  203  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>