More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3180 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_3180  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  100 
 
 
249 aa  498  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.507931  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4878  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58.02 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.62 
 
 
248 aa  238  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.79 
 
 
264 aa  229  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1602  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 
277 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1931  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.31 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1632  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.21 
 
 
275 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  0.0862863 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0002  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  47.41 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.82 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.81 
 
 
275 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158297 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000483  molybdopterin biosynthesis protein B  44.4 
 
 
249 aa  219  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.937598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  44.72 
 
 
252 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.18 
 
 
266 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.78 
 
 
249 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2974  molydopterin biosynthesis protein  46.96 
 
 
346 aa  215  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.78 
 
 
250 aa  215  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.9 
 
 
252 aa  214  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0513  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.4 
 
 
348 aa  214  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0795436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.19 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.90233  hitchhiker  0.0000000000838501 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1945  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.98 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410103  decreased coverage  0.00836902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  44.31 
 
 
253 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0597  molybdopterin biosynthesis protein  48.8 
 
 
349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.348969  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.5 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0089  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.43 
 
 
266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.5 
 
 
254 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.15 
 
 
251 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4744  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.24 
 
 
263 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.09 
 
 
252 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.09 
 
 
252 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.09 
 
 
252 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.94 
 
 
259 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.09 
 
 
252 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  42.74 
 
 
257 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.09 
 
 
252 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.09 
 
 
252 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4378  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.2 
 
 
261 aa  210  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0302  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.35 
 
 
249 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.5 
 
 
274 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.68 
 
 
252 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.4 
 
 
348 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.413698 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.5 
 
 
253 aa  209  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4128  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.37 
 
 
270 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal  0.228572 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  42.11 
 
 
257 aa  209  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.53 
 
 
251 aa  208  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2171  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.6 
 
 
255 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  46.15 
 
 
396 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.42 
 
 
278 aa  206  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4770  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.46 
 
 
256 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.53 
 
 
254 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.58 
 
 
266 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.44 
 
 
253 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  44.53 
 
 
389 aa  206  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0074  putative molybdopterin biosynthesis protein moeB  47.22 
 
 
267 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.72 
 
 
247 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3157  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.56 
 
 
261 aa  205  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2816  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  44.18 
 
 
249 aa  205  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0046  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.84 
 
 
266 aa  205  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  43.78 
 
 
377 aa  205  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2522  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.18 
 
 
249 aa  205  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.58 
 
 
253 aa  205  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.68 
 
 
392 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0617  molybdenum cofactor biosynthesis protein  46.64 
 
 
265 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.12 
 
 
259 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0462  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.6 
 
 
358 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.987597  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.24 
 
 
263 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4746  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.56 
 
 
251 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159527  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.62 
 
 
390 aa  203  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.94 
 
 
250 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.15 
 
 
395 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.94 
 
 
250 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.85 
 
 
403 aa  203  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.94 
 
 
250 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0215  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.25 
 
 
266 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.5 
 
 
266 aa  202  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.06 
 
 
252 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.53 
 
 
252 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1083  putative molybdopterin biosynthesis protein  43.09 
 
 
254 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365488  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0909  UBA/THIF-type NAD/FAD binding  45.16 
 
 
350 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  43.09 
 
 
245 aa  201  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  45.56 
 
 
480 aa  201  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.52 
 
 
252 aa  201  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.72 
 
 
260 aa  201  8e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.67 
 
 
387 aa  201  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  45.8 
 
 
386 aa  201  9e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.27 
 
 
255 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.94 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0038  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.25 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal  0.260889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  44.31 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0364  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.66 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.72 
 
 
393 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.31 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  39.68 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.69 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.31 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00436321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.62 
 
 
390 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  44.13 
 
 
393 aa  199  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.91 
 
 
364 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.28 
 
 
399 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.68 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.27 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>