More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1659 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1659  thiamine biosynthesis protein ThiF  100 
 
 
200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1158  thiamine biosynthesis protein ThiF  54.31 
 
 
201 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00601178  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0371  thiamine biosynthesis protein ThiF  50.76 
 
 
203 aa  194  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0600  thiamine biosynthesis protein ThiF  43 
 
 
214 aa  160  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0075  thiamine biosynthesis protein ThiF  43.5 
 
 
202 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1682  thiamine biosynthesis protein ThiF  44.28 
 
 
207 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000522342  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2513  thiamine biosynthesis protein ThiF  37.31 
 
 
219 aa  140  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000693793  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.5 
 
 
219 aa  132  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00160483  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  36.9 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.82 
 
 
268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0798  thiamine biosynthesis protein ThiF  34 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1833  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.83 
 
 
267 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125915  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1157  thiamine biosynthesis protein ThiF  38.59 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0774  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.09 
 
 
207 aa  124  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.703659  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1178  thiamine biosynthesis protein ThiF  39.04 
 
 
267 aa  124  8.000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3072  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.98 
 
 
267 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1138  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.2 
 
 
213 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2168  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.12 
 
 
214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1633  thiamine biosynthesis protein ThiF  36.52 
 
 
203 aa  119  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1276  thiamine biosynthesis protein ThiF  37.5 
 
 
283 aa  115  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0911002  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1149  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.61 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000110097  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1855  thiamine biosynthesis protein ThiF  42.86 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1572  thiamine biosynthesis protein ThiF  43.51 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109403  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.5 
 
 
267 aa  109  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  34 
 
 
267 aa  107  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3218  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.3 
 
 
281 aa  104  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  33 
 
 
267 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0074  thiamine biosynthesis protein ThiF  39.16 
 
 
237 aa  102  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.8 
 
 
242 aa  98.6  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1557  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.33 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  36.94 
 
 
247 aa  93.2  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.29 
 
 
288 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.29 
 
 
288 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.29 
 
 
288 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.29 
 
 
288 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.29 
 
 
288 aa  91.7  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.29 
 
 
286 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0902  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.29 
 
 
288 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1062  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.29 
 
 
341 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  28.57 
 
 
302 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.29 
 
 
255 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000273518  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.61 
 
 
300 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.87 
 
 
263 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  31.29 
 
 
285 aa  89  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  29.93 
 
 
268 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  29.93 
 
 
268 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.77 
 
 
259 aa  88.6  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135994 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.93 
 
 
300 aa  88.2  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0718  HesA/MoeB/ThiF family protein  30.61 
 
 
288 aa  87  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0036619  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  29.25 
 
 
268 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2615  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.93 
 
 
285 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0619  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.56 
 
 
244 aa  86.7  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.19184 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.61 
 
 
275 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.35 
 
 
274 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.29 
 
 
285 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  29.25 
 
 
268 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  30.61 
 
 
275 aa  87  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.41 
 
 
254 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  29.25 
 
 
268 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4440  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  29.14 
 
 
251 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259901 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2248  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.97 
 
 
240 aa  85.9  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1848  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.93 
 
 
285 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.84 
 
 
257 aa  86.3  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61808  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  29.53 
 
 
277 aa  86.3  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.33 
 
 
255 aa  85.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.28 
 
 
295 aa  85.5  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.25 
 
 
285 aa  85.9  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.93 
 
 
275 aa  85.5  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  30.61 
 
 
275 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.29 
 
 
389 aa  85.5  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.2 
 
 
480 aa  85.1  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  29.86 
 
 
273 aa  84.7  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1525  hypothetical protein  34.51 
 
 
287 aa  84  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1748  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.13 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000219934  normal  0.0173539 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.04 
 
 
242 aa  84  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03869  thiamine biosynthesis protein ThiF  28.48 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4002  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  28.48 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03822  hypothetical protein  28.48 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0597  molybdopterin biosynthesis protein  29.58 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.348969  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5899  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.16 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.58 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.413698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.53 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.93 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4226  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  28.48 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4534  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  28.48 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.3 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4033  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  28.48 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948961 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  28.57 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  28.57 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2502  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.04 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.61 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000533838  hitchhiker  0.000000527658 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0513  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.03 
 
 
348 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0795436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.78 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296557  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.37 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.43 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  28.57 
 
 
268 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5460  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  28.48 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218876 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 
268 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>