108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5075 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  726    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  32.96 
 
 		 390 aa  219  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  37.4 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  27.86 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  30.71 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  31.65 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  27.05 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  31.54 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  31.9 
 
 		 343 aa  99.4  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  27.44 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  29.33 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  36.84 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  28.21 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  28.21 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  30.84 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  31.05 
 
 		 368 aa  97.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  30.55 
 
 		 343 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  29.86 
 
 		 343 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  30.26 
 
 		 343 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  30.26 
 
 		 343 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  30.26 
 
 		 343 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  30.14 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  31.29 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  27.18 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  29.82 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  30.72 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  28.93 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  29.55 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39940  hypothetical protein  31.34 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  27 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  37.43 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  27.86 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  28.14 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  24.91 
 
 		 679 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  29.79 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  39.02 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  36.55 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  27.87 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  29.64 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  26.06 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  26.32 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  36.81 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  34.9 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  23.81 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  24.56 
 
 		 762 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  33.33 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  30.27 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  29.66 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  27.98 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  28.99 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1006 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  28.22 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  34.25 
 
 		 989 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  39.56 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  33.76 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  21.07 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  33.12 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  33.12 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  37.8 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  37.58 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  27.98 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  30.56 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  30.56 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  30.95 
 
 		 342 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  31.25 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  34.82 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  28.06 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  34.43 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  31.51 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  28.66 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  29.25 
 
 		 817 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  28.66 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  37.3 
 
 		 968 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  29.03 
 
 		 771 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  39.53 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  24.02 
 
 		 684 aa  56.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  28.4 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  34.71 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  37.1 
 
 		 730 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  32.28 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  34.3 
 
 		 318 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  34.3 
 
 		 318 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  34.3 
 
 		 318 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  41.94 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  33.82 
 
 		 710 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  31.45 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  31.25 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  24.23 
 
 		 770 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  31.25 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  31.25 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  30.21 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  34.11 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  34.11 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  34.11 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2618  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  33.02 
 
 		 279 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>