97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1474 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  93.1 
 
 
377 aa  728    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  778    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  57.61 
 
 
369 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  59.13 
 
 
368 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  44.69 
 
 
359 aa  299  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  47.63 
 
 
359 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  42.77 
 
 
318 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  34.82 
 
 
330 aa  202  8e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  35.87 
 
 
344 aa  189  8e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  31.17 
 
 
339 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  29.91 
 
 
361 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  31.89 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  31.89 
 
 
343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  32.1 
 
 
335 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  30.75 
 
 
343 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  31.48 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  30.96 
 
 
343 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  30.65 
 
 
343 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  30.96 
 
 
343 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  30.65 
 
 
343 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  30.65 
 
 
343 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  30.65 
 
 
343 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  30.28 
 
 
343 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  30.65 
 
 
343 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  30.53 
 
 
380 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  29.08 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  26.49 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  26.74 
 
 
375 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  29.19 
 
 
349 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  31.1 
 
 
377 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  31.1 
 
 
376 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  27.49 
 
 
332 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  30.75 
 
 
375 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  26.54 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  25.93 
 
 
330 aa  96.3  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  27.32 
 
 
384 aa  96.3  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  28.17 
 
 
324 aa  94  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  23.33 
 
 
330 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  27.49 
 
 
331 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  27.03 
 
 
402 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  26.73 
 
 
336 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  28.57 
 
 
320 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  27.22 
 
 
342 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  27.41 
 
 
315 aa  90.1  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  27.27 
 
 
323 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  23.82 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  27.71 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  27.38 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  25.78 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  23.48 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  29.69 
 
 
1006 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  25.69 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  23.17 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  27.8 
 
 
364 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  22.87 
 
 
330 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  22.87 
 
 
330 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  23.6 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  24.04 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  24.92 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  27.46 
 
 
328 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  24.46 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  24.69 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  23.71 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  22.52 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  22.52 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  25.36 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  22.52 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  22.74 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  24.53 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  26.46 
 
 
679 aa  66.6  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  22.87 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  22.87 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  22.87 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  22.63 
 
 
771 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  26.98 
 
 
817 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  27.92 
 
 
351 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  24.37 
 
 
380 aa  59.7  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  24.12 
 
 
336 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  21.6 
 
 
335 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  21.3 
 
 
335 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  21.3 
 
 
335 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  23.35 
 
 
770 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  23.17 
 
 
327 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39940  hypothetical protein  24.64 
 
 
382 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  21.9 
 
 
342 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  22.82 
 
 
332 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  22.39 
 
 
325 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  22.39 
 
 
325 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  21.78 
 
 
327 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  21.21 
 
 
331 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  22.39 
 
 
325 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  24.42 
 
 
355 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  20.68 
 
 
730 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  30.34 
 
 
271 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  28.57 
 
 
672 aa  46.6  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02470  hypothetical protein  27.87 
 
 
325 aa  46.2  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  20.26 
 
 
331 aa  42.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>