49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39940 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_39940  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  747    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111954  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  34.02 
 
 		 378 aa  173  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  29.62 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  26.44 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  29.52 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  30 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  29.03 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  34.19 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  34.19 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  34.19 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  34.19 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  34.19 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  29.03 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  34.19 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  31.34 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  30.69 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  28.1 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  25.53 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  23.87 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  28.73 
 
 		 368 aa  57  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  28.34 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  36.89 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  24.28 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  25.94 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  29.17 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  36.72 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  25.8 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  26.23 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  29.7 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  37.04 
 
 		 343 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  27.71 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  27.84 
 
 		 335 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  23.38 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  31.54 
 
 		 331 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  32.54 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  29.17 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  29.93 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  30.33 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  27.22 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  20.77 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  37.24 
 
 		 359 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  26.9 
 
 		 323 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  27.2 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  35.11 
 
 		 349 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  35.78 
 
 		 318 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  35.78 
 
 		 318 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  28.39 
 
 		 335 aa  43.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1140  hypothetical protein  42.03 
 
 		 382 aa  43.1  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0783144  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  35.78 
 
 		 318 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>