64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1140 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1140  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  704    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0783144  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  26.79 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  24 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  29.95 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02470  hypothetical protein  37.37 
 
 
325 aa  69.3  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  26.58 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  40.95 
 
 
392 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  25.85 
 
 
344 aa  57  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  35.11 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  44.86 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  34.15 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  27.71 
 
 
342 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  44.86 
 
 
382 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  31.07 
 
 
330 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  46.15 
 
 
315 aa  53.1  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  44.16 
 
 
318 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  40.48 
 
 
331 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  37.8 
 
 
339 aa  52.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  37.93 
 
 
329 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  33.65 
 
 
343 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  33.65 
 
 
343 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  33.65 
 
 
343 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  30.57 
 
 
343 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  33.65 
 
 
343 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  33.65 
 
 
343 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39940  hypothetical protein  30.55 
 
 
382 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111954  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  43.04 
 
 
318 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  43.04 
 
 
318 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  43.04 
 
 
318 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  34.19 
 
 
331 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  48.44 
 
 
328 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  40 
 
 
279 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  41.25 
 
 
336 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  40 
 
 
297 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  40.23 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3521  hypothetical protein  26.63 
 
 
353 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  39.19 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2618  hypothetical protein  40 
 
 
297 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  30.65 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  26.87 
 
 
377 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  24.77 
 
 
679 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  38.16 
 
 
349 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  36.36 
 
 
343 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  26.87 
 
 
377 aa  46.6  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  32.05 
 
 
771 aa  46.2  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  31.73 
 
 
343 aa  46.2  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  48.44 
 
 
325 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  36.59 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  36.59 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  36.59 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  43.94 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  54.55 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  54.55 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  52.94 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  35.44 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  40.28 
 
 
349 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  43.94 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  45.28 
 
 
361 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  37.18 
 
 
330 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  37.18 
 
 
330 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  37.18 
 
 
330 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  29.69 
 
 
402 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  39.02 
 
 
271 aa  43.1  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  33.68 
 
 
323 aa  43.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>