111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0286 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  100 
 
 
336 aa  659    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  45.02 
 
 
320 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  41.21 
 
 
361 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  41.42 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  42.04 
 
 
331 aa  172  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  41.04 
 
 
324 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  37.74 
 
 
349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  38.17 
 
 
380 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  39.33 
 
 
375 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  40 
 
 
332 aa  159  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  36.76 
 
 
335 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  37.81 
 
 
323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  35.87 
 
 
335 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  37.27 
 
 
376 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  37.16 
 
 
377 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  36.99 
 
 
325 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  34.46 
 
 
343 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  38.18 
 
 
335 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  33.43 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  33.85 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  31.99 
 
 
339 aa  132  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  37.81 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  33.13 
 
 
343 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  32.92 
 
 
332 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  32.73 
 
 
330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  33.43 
 
 
335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  38.71 
 
 
315 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  33.53 
 
 
330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  33.13 
 
 
335 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  33.13 
 
 
335 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  37.42 
 
 
343 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  33.13 
 
 
359 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  33.54 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  38.32 
 
 
346 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  34.35 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  33.64 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  33.64 
 
 
343 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  33.33 
 
 
343 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  31.29 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  33.65 
 
 
325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  33.65 
 
 
325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  33.33 
 
 
343 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  33.33 
 
 
343 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  33.65 
 
 
325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  33.33 
 
 
343 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  34.6 
 
 
380 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  32.23 
 
 
331 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  32.48 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  33.33 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  34.43 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  34.43 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  34.82 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  34.98 
 
 
343 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  31.42 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  32.91 
 
 
330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  32.91 
 
 
330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  32.91 
 
 
330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  35.69 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  27.1 
 
 
330 aa  110  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  30.89 
 
 
331 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  36.05 
 
 
349 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  29.21 
 
 
318 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  31.64 
 
 
367 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  32.48 
 
 
326 aa  99.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  31.67 
 
 
342 aa  99.4  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  27.22 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  31.55 
 
 
318 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  31.55 
 
 
318 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  31.55 
 
 
318 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  33.23 
 
 
336 aa  93.2  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  33.33 
 
 
355 aa  93.6  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  29.56 
 
 
392 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  26.73 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  26.13 
 
 
344 aa  89.4  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  31.68 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  31.68 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  31.68 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  28.97 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  28.49 
 
 
368 aa  86.7  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  25.87 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  27.97 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  27.38 
 
 
369 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  27.36 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  27.73 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  29.91 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  28.57 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  25.61 
 
 
770 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  28.89 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  28.89 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  28.06 
 
 
679 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  27.86 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  28.14 
 
 
1006 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  24.39 
 
 
771 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  35.77 
 
 
402 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  29.65 
 
 
273 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  25.44 
 
 
762 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  27.84 
 
 
968 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  34.07 
 
 
710 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  27.06 
 
 
384 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  18.81 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>