95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4203 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  644    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  58.95 
 
 
331 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  53.37 
 
 
332 aa  334  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  57.36 
 
 
326 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  57.36 
 
 
326 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  57.36 
 
 
326 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  52.31 
 
 
327 aa  328  7e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  55.38 
 
 
331 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  52.62 
 
 
335 aa  322  8e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  52.62 
 
 
335 aa  322  8e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  52.62 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  50.94 
 
 
344 aa  296  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  51.23 
 
 
327 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  39.88 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  41.41 
 
 
325 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  37.35 
 
 
332 aa  170  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  35.87 
 
 
329 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  35.87 
 
 
330 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  35.76 
 
 
318 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  35.76 
 
 
318 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  35.76 
 
 
318 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  34.48 
 
 
330 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  34.48 
 
 
330 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  34.48 
 
 
330 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  37.54 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  37.54 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  37.54 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  33.55 
 
 
380 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  33.22 
 
 
382 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  33.85 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  33.65 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  32.71 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  32.71 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  32.71 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  32.71 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  32.71 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  32.4 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  32.72 
 
 
361 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  32.34 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  30 
 
 
343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  31.42 
 
 
335 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  34.07 
 
 
342 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  31.15 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  32.03 
 
 
349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  30.65 
 
 
343 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  29.72 
 
 
380 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  30.42 
 
 
324 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  29.18 
 
 
343 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  34.12 
 
 
335 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  31.53 
 
 
342 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  29.4 
 
 
367 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  30.7 
 
 
335 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  30.87 
 
 
323 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  29.7 
 
 
330 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  28.75 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  29.77 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  33.01 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  29.37 
 
 
333 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  32.27 
 
 
343 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  32.44 
 
 
320 aa  93.2  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  29.75 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  33.43 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  31.48 
 
 
332 aa  85.9  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  45.92 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  30 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  29.41 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  29.41 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  28.3 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  30.45 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  25.53 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  37.76 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  37.76 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2618  hypothetical protein  37.76 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  29.27 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  29.88 
 
 
326 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  31.27 
 
 
355 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  32.74 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  24.38 
 
 
679 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  23.26 
 
 
344 aa  56.6  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  22.7 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  26.4 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  36.36 
 
 
1006 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  31.97 
 
 
378 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  20.97 
 
 
330 aa  53.1  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  23.17 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  24.46 
 
 
359 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  22.09 
 
 
318 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  35.54 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  29.27 
 
 
989 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  26.67 
 
 
762 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02470  hypothetical protein  46.97 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  25.83 
 
 
771 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  26.06 
 
 
368 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>