171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1780 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1780  PEBP family protein  100 
 
 
168 aa  343  8e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2135  PEBP family protein  50 
 
 
170 aa  171  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000011706  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0061  phospholipid-binding protein  44.77 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0979  PEBP family protein  43.53 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0998  PEBP family protein  43.53 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.516792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1141  PEBP family protein  35.62 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1263  Raf-like protein  38.06 
 
 
183 aa  100  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227442 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1273  phospholipid-binding protein  36.47 
 
 
184 aa  97.8  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  34.11 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  32.8 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  34.96 
 
 
617 aa  68.6  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  32.03 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  33.83 
 
 
150 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  30.47 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  36.59 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  33.59 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  34.59 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  32.8 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1202  PEBP family protein  35.88 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  31.54 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  31.54 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0279  PBP family phospholipid-binding protein  40.62 
 
 
200 aa  62  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181285 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  30 
 
 
181 aa  61.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  40 
 
 
179 aa  61.2  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  31.54 
 
 
150 aa  60.5  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  34.71 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  30.77 
 
 
193 aa  59.7  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0106  PEBP family protein  31.45 
 
 
203 aa  58.9  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0330816 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  32.82 
 
 
154 aa  59.3  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  32.33 
 
 
159 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  32.33 
 
 
159 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  34.38 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  35.11 
 
 
185 aa  57.8  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  37.5 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  30.47 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  32.03 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  34.4 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  29.69 
 
 
175 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  26.98 
 
 
192 aa  55.1  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  34.4 
 
 
182 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  33.86 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  30.95 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  33.07 
 
 
194 aa  54.3  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0538  PEBP family protein  29.13 
 
 
193 aa  54.3  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.092154  normal  0.34309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  30.47 
 
 
149 aa  54.3  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  30.23 
 
 
206 aa  54.3  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  33.6 
 
 
182 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  33.06 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  28.79 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  29.55 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3229  PBP family phospholipid-binding protein  29.73 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  31.85 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  31 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0141  PEBP family protein  32.47 
 
 
208 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  36 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  28.46 
 
 
191 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  34.11 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  28.79 
 
 
157 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0657  PBP family phospholipid-binding protein  25.62 
 
 
208 aa  51.6  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  35.05 
 
 
183 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0182  PBP family phospholipid-binding protein  35.42 
 
 
186 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333114  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  29.92 
 
 
179 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  35.05 
 
 
183 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  31.11 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2196  PEBP family protein  30.71 
 
 
180 aa  50.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00567412  hitchhiker  0.00102935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  33.33 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  29.23 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  30.56 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  29.37 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  29.03 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  31.68 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  27.56 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1321  PEBP family protein  30.17 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  30.4 
 
 
153 aa  48.5  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3372  PBP family phospholipid-binding protein  36 
 
 
167 aa  48.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00311199  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0478  PBP family phospholipid-binding protein  28.83 
 
 
215 aa  47.8  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591759  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  28.79 
 
 
188 aa  47.8  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  28.03 
 
 
179 aa  47.8  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4535  PEBP family protein  35.35 
 
 
177 aa  47.8  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460349  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  32 
 
 
207 aa  47.4  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12230  conserved hypothetical protein TIGR00481  34.34 
 
 
161 aa  47.4  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.888512  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2718  PEBP family protein  34.74 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0707  PBP family phospholipid-binding protein  29.75 
 
 
209 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.148396 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0135  YbhB and YbcL  32.41 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0912  PBP family phospholipid-binding protein  30.69 
 
 
178 aa  47  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0224568  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  27.78 
 
 
153 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  32.41 
 
 
189 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  30.07 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1141  PEBP family protein  36.17 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  30.07 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1145  putative kinase inhibitor protein  41.07 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38600  phospholipid-binding protein, PBP family  33.68 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1618  PEBP family protein  30.65 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.82166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  34.02 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  29.6 
 
 
190 aa  45.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0419  PBP family phospholipid-binding protein  28.22 
 
 
215 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  35.71 
 
 
181 aa  45.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3488  PEBP family protein  34.04 
 
 
178 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274615  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4114  PEBP family protein  33.68 
 
 
177 aa  45.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>