More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0988 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0864  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  100 
 
 		 514 aa  980    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 497 aa  977    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263412 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 519 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 519 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 519 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 519 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 		 519 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 		 519 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 		 519 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 		 519 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 		 519 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 		 519 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 		 519 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.53 
 
 		 520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.27 
 
 		 519 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.31 
 
 		 520 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.42 
 
 		 520 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.07 
 
 		 511 aa  233  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.34 
 
 		 520 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.25 
 
 		 520 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.34 
 
 		 520 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 		 519 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.2 
 
 		 519 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 		 520 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.72 
 
 		 521 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 		 520 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 		 520 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.51 
 
 		 517 aa  230  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.72 
 
 		 520 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.51 
 
 		 520 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.72 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.72 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.72 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.72 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  30.82 
 
 		 518 aa  228  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 		 519 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2736  multidrug resistance protein Y  29.9 
 
 		 512 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.416223  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3598  multidrug resistance protein Y  30.1 
 
 		 512 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0257273 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.9 
 
 		 512 aa  226  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2653  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.9 
 
 		 512 aa  226  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1302  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 		 512 aa  226  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2517  multidrug resistance protein Y  29.9 
 
 		 512 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.28 
 
 		 511 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  29.28 
 
 		 511 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  29.28 
 
 		 511 aa  226  7e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.89 
 
 		 525 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.08 
 
 		 537 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  28.89 
 
 		 512 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  28.89 
 
 		 512 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  28.89 
 
 		 512 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  28.89 
 
 		 512 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1635  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.07 
 
 		 520 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296627  decreased coverage  0.000294236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02277  predicted multidrug efflux system  29.9 
 
 		 512 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.866508  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02238  hypothetical protein  29.9 
 
 		 512 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.945599  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 518 aa  223  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  30.99 
 
 		 519 aa  223  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.03 
 
 		 511 aa  223  9e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.48 
 
 		 543 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.98 
 
 		 510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2504  multidrug resistance protein Y  29.9 
 
 		 512 aa  221  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0957152  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 		 517 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 		 522 aa  221  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.01 
 
 		 577 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.6 
 
 		 513 aa  220  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.17 
 
 		 520 aa  220  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.53 
 
 		 520 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.2 
 
 		 531 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.94 
 
 		 517 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5791  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.12 
 
 		 517 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0859755  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.93 
 
 		 544 aa  218  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.53 
 
 		 518 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  28.89 
 
 		 512 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 533 aa  216  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  28.69 
 
 		 512 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.69 
 
 		 512 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  28.69 
 
 		 512 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  28.69 
 
 		 512 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  28.69 
 
 		 512 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  28.69 
 
 		 512 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.69 
 
 		 512 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
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NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.53 
 
 		 518 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
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NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  28.69 
 
 		 512 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0252817 
 
 
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NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.66 
 
 		 515 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 		 511 aa  213  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
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NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.79 
 
 		 524 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.22 
 
 		 520 aa  213  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
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NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.67 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 527 aa  211  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.22 
 
 		 529 aa  210  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 		 528 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 		 527 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  27.09 
 
 		 528 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  27.09 
 
 		 528 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  27.09 
 
 		 528 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 		 527 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 		 528 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  27.09 
 
 		 528 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 		 528 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  27.09 
 
 		 528 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
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