More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10960 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_10960  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 480 aa  935    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0134963  normal  0.0668977 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09120  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.34 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.296605  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2234  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.29 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2494  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.26 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1392  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.94 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292581  decreased coverage  0.00432039 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0658  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.99 
 
 		 393 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3428  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.67 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2125  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.12 
 
 		 413 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147567  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0979  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.71 
 
 		 391 aa  359  7e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1567  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.72 
 
 		 413 aa  355  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0244087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1185  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.57 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291994  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1295  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.24 
 
 		 411 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.182603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4020  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.48 
 
 		 407 aa  353  5e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2775  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.26 
 
 		 391 aa  347  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.41655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8003  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.14 
 
 		 395 aa  345  8e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2548  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.58 
 
 		 394 aa  340  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221459  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1146  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.16 
 
 		 431 aa  339  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0800411  normal  0.0132649 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1237  signal recognition particle GTPase  58.28 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4186  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.58 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1464  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.14 
 
 		 399 aa  334  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.359002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3150  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.45 
 
 		 321 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000013579  hitchhiker  0.00179323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12935  cell division protein ftsY  60 
 
 		 422 aa  330  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000035929  normal  0.45291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0220  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.61 
 
 		 394 aa  329  8e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3596  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.28 
 
 		 414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1955  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.9 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345625  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1935  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.9 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2001  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.9 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.805492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23810  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.23 
 
 		 405 aa  323  5e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235092  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7989  cell division membrane protein  62.7 
 
 		 394 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0488836  normal  0.407167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2177  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.56 
 
 		 449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0072  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.45 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1161  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.3 
 
 		 388 aa  320  5e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2077  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.67 
 
 		 531 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.0051754  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1607  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.22 
 
 		 479 aa  313  4.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09610  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.56 
 
 		 516 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.640999  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5945  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.54 
 
 		 490 aa  302  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3270  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.78 
 
 		 376 aa  280  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0718  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.82 
 
 		 465 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  hitchhiker  0.00719996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.52 
 
 		 302 aa  263  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.97 
 
 		 373 aa  261  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.27 
 
 		 501 aa  261  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.23 
 
 		 497 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.6 
 
 		 312 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.23 
 
 		 494 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.13 
 
 		 510 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.23 
 
 		 514 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.04 
 
 		 310 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  44.01 
 
 		 350 aa  257  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.04 
 
 		 320 aa  257  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  47.85 
 
 		 362 aa  256  6e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.56 
 
 		 295 aa  256  8e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.94 
 
 		 335 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.28 
 
 		 320 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0619  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.67 
 
 		 347 aa  254  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.95 
 
 		 351 aa  254  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.57 
 
 		 302 aa  254  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.1 
 
 		 340 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  44.98 
 
 		 305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.43 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0707  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.18 
 
 		 469 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.34 
 
 		 452 aa  252  8.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0277  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.28 
 
 		 546 aa  252  9.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0708  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.85 
 
 		 469 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  44.65 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.68 
 
 		 342 aa  252  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0673  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.85 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191674  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1588  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.12 
 
 		 518 aa  252  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.51 
 
 		 405 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.25 
 
 		 513 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.11 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  47.29 
 
 		 317 aa  251  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0361  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.15 
 
 		 408 aa  251  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0466  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.1 
 
 		 433 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.51 
 
 		 326 aa  250  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1181  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.18 
 
 		 506 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0879214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4411  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.53 
 
 		 437 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0308  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.59 
 
 		 392 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.13 
 
 		 375 aa  247  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  42.72 
 
 		 471 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.81 
 
 		 540 aa  247  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2845  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.87 
 
 		 493 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.634202 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  44.7 
 
 		 408 aa  246  6e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.63 
 
 		 320 aa  246  6e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6139  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.78 
 
 		 388 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.23 
 
 		 561 aa  246  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  40 
 
 		 481 aa  246  8e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2950  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.72 
 
 		 488 aa  246  8e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260236  hitchhiker  0.00455351 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0746  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.37 
 
 		 476 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.36 
 
 		 416 aa  246  8e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0576  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.37 
 
 		 476 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.36 
 
 		 416 aa  246  8e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3410  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.87 
 
 		 473 aa  246  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.28 
 
 		 381 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1493  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.37 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4140  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.89 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.38 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.67 
 
 		 380 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2922  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.37 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0096  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.37 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.838826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.77 
 
 		 301 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>