More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3596 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3596  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 414 aa  787    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1146  signal recognition particle-docking protein FtsY  86.08 
 
 		 431 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0800411  normal  0.0132649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0658  signal recognition particle-docking protein FtsY  70.13 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1392  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.94 
 
 		 391 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292581  decreased coverage  0.00432039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2125  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.18 
 
 		 413 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147567  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1185  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.24 
 
 		 395 aa  395  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291994  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1295  signal recognition particle-docking protein FtsY  58 
 
 		 411 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.182603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8003  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.93 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2775  signal recognition particle-docking protein FtsY  70.7 
 
 		 391 aa  388  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.41655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4020  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.58 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3428  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.15 
 
 		 389 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1567  signal recognition particle-docking protein FtsY  71.2 
 
 		 413 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0244087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4186  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.31 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12935  cell division protein ftsY  64.13 
 
 		 422 aa  378  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000035929  normal  0.45291 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10960  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.93 
 
 		 480 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0134963  normal  0.0668977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2177  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.01 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0220  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.91 
 
 		 394 aa  365  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1935  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.21 
 
 		 458 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1955  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.21 
 
 		 466 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2001  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.21 
 
 		 466 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.805492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7989  cell division membrane protein  69.03 
 
 		 394 aa  356  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0488836  normal  0.407167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2494  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.16 
 
 		 404 aa  353  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09120  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.33 
 
 		 393 aa  349  7e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.296605  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2234  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.56 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014808 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0979  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.86 
 
 		 391 aa  346  4e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1237  signal recognition particle GTPase  57.72 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1464  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.79 
 
 		 399 aa  338  7e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.359002 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3270  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.05 
 
 		 376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3150  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.2 
 
 		 321 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000013579  hitchhiker  0.00179323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09610  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.51 
 
 		 516 aa  336  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.640999  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5945  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.6 
 
 		 490 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1607  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.39 
 
 		 479 aa  332  6e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1161  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.52 
 
 		 388 aa  331  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273828  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2548  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.78 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221459  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23810  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.33 
 
 		 405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235092  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2077  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.67 
 
 		 531 aa  321  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.0051754  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0072  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.88 
 
 		 393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.06 
 
 		 510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.15 
 
 		 342 aa  273  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0718  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.5 
 
 		 465 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  hitchhiker  0.00719996 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.17 
 
 		 405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  49 
 
 		 362 aa  270  5e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.05 
 
 		 497 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.5 
 
 		 351 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.05 
 
 		 494 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.05 
 
 		 514 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  45.72 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.45 
 
 		 340 aa  266  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.55 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.21 
 
 		 485 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.02 
 
 		 295 aa  265  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  47.13 
 
 		 505 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.71 
 
 		 513 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  45.51 
 
 		 350 aa  262  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.05 
 
 		 312 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0366  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.84 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0348  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.84 
 
 		 294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  44.95 
 
 		 495 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0317  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.35 
 
 		 483 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.87 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0707  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.05 
 
 		 469 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0708  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.25 
 
 		 469 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  44 
 
 		 481 aa  257  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1768  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.68 
 
 		 304 aa  257  3e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00021093  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  44.63 
 
 		 471 aa  257  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.87 
 
 		 326 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.75 
 
 		 373 aa  256  6e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.94 
 
 		 335 aa  256  7e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0673  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.89 
 
 		 444 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191674  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.84 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4328  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.74 
 
 		 413 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.19 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.93 
 
 		 523 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.47 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.72 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  45.93 
 
 		 553 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.7 
 
 		 320 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  49.34 
 
 		 671 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.03 
 
 		 416 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.87 
 
 		 451 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.03 
 
 		 416 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  46.51 
 
 		 317 aa  252  7e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  45.6 
 
 		 541 aa  252  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0619  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.13 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124261  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.51 
 
 		 475 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.71 
 
 		 501 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.24 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.95 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0382  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.15 
 
 		 304 aa  251  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0029967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.6 
 
 		 310 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.92 
 
 		 317 aa  250  3e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.16 
 
 		 453 aa  250  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4170  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.79 
 
 		 313 aa  249  5e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  43.69 
 
 		 407 aa  249  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  43.71 
 
 		 511 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.08 
 
 		 540 aa  249  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3700  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.33 
 
 		 377 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.24 
 
 		 309 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  48.53 
 
 		 451 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  44.37 
 
 		 408 aa  249  8e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>