More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2125 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2125  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 
413 aa  808    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147567  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1185  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.9 
 
 
395 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291994  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1295  signal recognition particle-docking protein FtsY  76.24 
 
 
411 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.182603  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0658  signal recognition particle-docking protein FtsY  70.19 
 
 
393 aa  418  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2775  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.21 
 
 
391 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.41655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3428  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.73 
 
 
389 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8003  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.94 
 
 
395 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4020  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.12 
 
 
407 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1567  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.86 
 
 
413 aa  388  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0244087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1146  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.06 
 
 
431 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0800411  normal  0.0132649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09120  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.95 
 
 
393 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.296605  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2234  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.27 
 
 
400 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2494  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.56 
 
 
404 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0220  signal recognition particle-docking protein FtsY  60 
 
 
394 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7989  cell division membrane protein  71.2 
 
 
394 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0488836  normal  0.407167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3270  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.07 
 
 
376 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4186  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.84 
 
 
469 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10960  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.67 
 
 
480 aa  360  3e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0134963  normal  0.0668977 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1464  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.89 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.359002 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1392  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.36 
 
 
391 aa  355  6.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292581  decreased coverage  0.00432039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1955  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.12 
 
 
466 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345625  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1935  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.12 
 
 
458 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2001  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.12 
 
 
466 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.805492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2177  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.65 
 
 
449 aa  353  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159993  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3596  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.55 
 
 
414 aa  350  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1161  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.55 
 
 
388 aa  347  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273828  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3150  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.62 
 
 
321 aa  345  6e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000013579  hitchhiker  0.00179323 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23810  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.94 
 
 
405 aa  345  7e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235092  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2548  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.78 
 
 
394 aa  338  8e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221459  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0979  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.11 
 
 
391 aa  338  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12935  cell division protein ftsY  61.61 
 
 
422 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000035929  normal  0.45291 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0072  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.05 
 
 
393 aa  332  7.000000000000001e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1607  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.58 
 
 
479 aa  332  9e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09610  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.56 
 
 
516 aa  331  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.640999  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1237  signal recognition particle GTPase  54.97 
 
 
423 aa  325  6e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2077  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.37 
 
 
531 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.0051754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5945  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.74 
 
 
490 aa  324  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.51 
 
 
340 aa  279  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.52 
 
 
432 aa  269  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.57 
 
 
452 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.19 
 
 
320 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.82 
 
 
416 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.82 
 
 
416 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  48.36 
 
 
350 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  46.53 
 
 
471 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.31 
 
 
481 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  48.67 
 
 
317 aa  264  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.37 
 
 
312 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.01 
 
 
295 aa  263  3e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.88 
 
 
342 aa  263  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.85 
 
 
351 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  46.84 
 
 
305 aa  262  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.23 
 
 
510 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.77 
 
 
501 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.86 
 
 
453 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.43 
 
 
373 aa  261  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  45.87 
 
 
495 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1768  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 
304 aa  260  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00021093  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0619  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.16 
 
 
347 aa  260  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124261  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.54 
 
 
494 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.03 
 
 
320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.68 
 
 
540 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.59 
 
 
405 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  45.22 
 
 
408 aa  258  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.33 
 
 
320 aa  258  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.63 
 
 
514 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1181  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.82 
 
 
506 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0879214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.92 
 
 
491 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.87 
 
 
317 aa  257  3e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.06 
 
 
301 aa  257  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0277  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.06 
 
 
546 aa  257  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3686  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.2 
 
 
331 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.915822  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.21 
 
 
497 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.35 
 
 
485 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  42.22 
 
 
541 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  47.67 
 
 
362 aa  256  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.66 
 
 
482 aa  256  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.28 
 
 
326 aa  256  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  46.01 
 
 
505 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.71 
 
 
302 aa  256  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  45.21 
 
 
498 aa  255  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  45.07 
 
 
512 aa  255  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.93 
 
 
643 aa  255  9e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1680  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.4 
 
 
444 aa  255  9e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.990278  normal  0.232979 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  45.21 
 
 
498 aa  255  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  45.21 
 
 
498 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.21 
 
 
497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.19 
 
 
523 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.37 
 
 
535 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  47.19 
 
 
541 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.54 
 
 
611 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  45.21 
 
 
498 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.54 
 
 
615 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.54 
 
 
621 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  47.04 
 
 
553 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  45.21 
 
 
498 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.68 
 
 
329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0718  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  hitchhiker  0.00719996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  45.29 
 
 
497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1921  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.25 
 
 
346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0684564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>