More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4149 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4149  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  650    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3843  transcriptional regulator  56.4 
 
 		 340 aa  360  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00298813  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4990  transcriptional regulator, LacI family  60.06 
 
 		 342 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0202864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2830  transcriptional regulator, LacI family  51.39 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3911  transcriptional regulator, LacI family  46.89 
 
 		 325 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.363783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1474  transcriptional regulator, LacI family  49.07 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3623  transcriptional regulator, LacI family  46.96 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6529  transcriptional regulator, LacI family  46.6 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0128002 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4158  alanine racemase  43.65 
 
 		 416 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2147  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.25 
 
 		 340 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0913  transcriptional regulator, LacI family  42.68 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  37.35 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  38.25 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  37.58 
 
 		 340 aa  162  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2581  LacI family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 335 aa  155  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  34.43 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  31.1 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  34.94 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  36.8 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  34.43 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  34.32 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  29.52 
 
 		 342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  36.67 
 
 		 340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  34.02 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  34.22 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  38.51 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.12 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.64 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  32.62 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  35.03 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  36.02 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  32.93 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0881  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.9 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188257  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  34.24 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  35.5 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  34.25 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  35.59 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  34.83 
 
 		 344 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.33 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  34.24 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.82 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1050  transcriptional regulator, LacI family  38.05 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.24 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.03 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  35.95 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  35.84 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.44 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.75 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  31.45 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  40.99 
 
 		 346 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  30.25 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  31.45 
 
 		 343 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  31.45 
 
 		 343 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.54 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  32.36 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7655  LacI family transcription regulator  34.37 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.254104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  29.73 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 348 aa  142  9e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  31.75 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1481  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.13 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  32.16 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.36 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  32.85 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  30.49 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  35.89 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  30.82 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  30.89 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  31.16 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  29.94 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  30.51 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  31.16 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  31.16 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.23 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  35.61 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  30.51 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  30.51 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  31.23 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  29.13 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  31.23 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  36.93 
 
 		 371 aa  139  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  35.53 
 
 		 382 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  30.51 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  30.51 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  30.24 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3109  transcriptional regulator, LacI family  34.64 
 
 		 337 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  28.33 
 
 		 327 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  34.63 
 
 		 340 aa  139  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.61 
 
 		 332 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  26.3 
 
 		 324 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>