More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6529 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6529  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 338 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0128002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2147  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  71.68 
 
 		 340 aa  505  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3911  transcriptional regulator, LacI family  64.29 
 
 		 325 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.363783 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3623  transcriptional regulator, LacI family  65.23 
 
 		 354 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4158  alanine racemase  58.77 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2830  transcriptional regulator, LacI family  45.43 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3843  transcriptional regulator  44.21 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00298813  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4149  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  46.6 
 
 		 333 aa  262  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4990  transcriptional regulator, LacI family  44.01 
 
 		 342 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0202864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1474  transcriptional regulator, LacI family  39.82 
 
 		 345 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  38.51 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0913  transcriptional regulator, LacI family  35.84 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  35.22 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  31.9 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.52 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  32.25 
 
 		 336 aa  162  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.12 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.33 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  30.33 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3846  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00500845  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1481  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.83 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  32.75 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  32.12 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.7 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.34 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  32.42 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  31.14 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3715  transcriptional regulator, LacI family  32.83 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372976 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.94 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  31.95 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  30.84 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  31.14 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  32.25 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  30.84 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  30.45 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  31.14 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  31.14 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  30.84 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  31.14 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  32.34 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2894  transcriptional regulator, LacI family  32.67 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  31.14 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  33.03 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  28.7 
 
 		 342 aa  149  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  30.75 
 
 		 340 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  32.26 
 
 		 343 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4611  transcriptional regulator, LacI family  34.8 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  33.13 
 
 		 361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  30.36 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.84 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  30.15 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7045  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 364 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  33.84 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  31.23 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  33.53 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2898  transcriptional regulator, LacI family  33.71 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  29.64 
 
 		 348 aa  146  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  31.64 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.02 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.33 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.12 
 
 		 339 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0590  LacI family transcription regulator  30.79 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000145078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  29.59 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29.08 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0052  LacI family transcription regulator  32.76 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  31.61 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  31.74 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  32.56 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  32.07 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  32.56 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  32.56 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  31.74 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  35.1 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  32.05 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.63 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  32.56 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3139  LacI family transcription regulator  30.62 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  31.34 
 
 		 338 aa  143  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  34.19 
 
 		 351 aa  142  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  31.31 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  32.23 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.61 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  32.56 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  30.63 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  32.56 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  29.17 
 
 		 337 aa  142  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  32.55 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  31.36 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>